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Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » – Besançon, 3 et 4 décembre 2015 1 sur 28
Gestion et valorisation des données de la recherche des laboratoires et
équipes de l'OSU THETA
Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon »Besançon, 3 et 4 décembre 2015
Sylvie DamyChrono-environnement
Bernard DebrayUTINAM
Gaëlle Laporte
OSU THETA
Raphaël Melior
OSU THETA
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Données de la recherche : Contexte Général
Mouvement Open data :
Accessibilité et disponibilité des données numériques
- Les directives :
- Déclaration de Berlin 2003
- OCDE : Accès aux données de la recherche 2006
- Directive Inspire 2007
- Horizon 2020
- Les projets ou groupes de travail:
- Data Seal of Approval
- ICSU-WDS (World Data System) 2008
- Datacite 2009
- Research Data Alliance 2013
Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » – Besançon, 3 et 4 décembre 2015 3 sur 28
Données de la recherche : Contexte Général
90% des données de
la recherche seraient
stockées sur les
disques durs locaux et
potentiellement non
réutilisables par
d'autres (de Waard A. Making
Research Data
Discoverable and Usable,
2013)
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Données de la recherche : Contexte Disciplinaire
Ecologie – Environnement :
– UMS BEES
– Zone atelier
– Ecoscope
– AllEnvi
Astronomie :
– Observatoire Virtuel
Physique atomique et moléculaire :
– VAMDC
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Données de la recherche : Contexte local
• Mise en place de l’OSU THETA (2007-2009) avec un axe bases de données, interopérabilité
• Création de l’axe transversal BD (2012) de Chrono-environnement et projet OREAS
• Journée BD 2013 (38 participants)
• Participation au FRéDoc 2013 « Gestion et valorisation des données de la recherche »
• OV pour les outils de simulation et bases de données astronomique et physique (Utinam, SMPCA/LICB)
• Bases de données et réseaux en climatologie et environnement (Biogéosciences)
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Le projet dat@OSU
Gestion et valorisation des données produitesdans nos laboratoires et équipes
Mise en place des outils et protocolespermettant de publier, faire connaître nosdonnées
Projet pluri-disciplinaire
OSU THETA
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Portails
nationaux,
internationaux
Le projet dat@OSU
ChercheurDonnées
du
chercheur
Métadonnées
Utilisateurs/chercheurs
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Objectifs du projet
Pérenniser
Partager
Valoriser
Rendre visible
Valoriser les structures : observatoire, laboratoires, équipes
Homogénéisation de présentation
Meilleure diffusion et exploitation des données
Mutualisation de nos efforts et savoir-faire
Données
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Définition du
profil de
métadonnées
Etude de
l’existant
Développement
de l’application
Collecte des
informations
Les étapes du projet
Co
mm
un
ica
tion
su
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pro
jet
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Définition du
profil de
métadonnées
Etude de
l’existant
Développement
de l’application
Collecte des
informations
Le projet SRO
Co
mm
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ica
tion
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Demande de CDD de 4 mois d’un
poste de documentaliste (IE chargé(e)
de ressources documentaires)
Embauche de Gaëlle Laporte
Mai-septembre 2014
Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » – Besançon, 3 et 4 décembre 2015 11 sur 28
Organisation dans les laboratoires
Equipe noyau : S. Damy (Chrono-environnement), B. Debray (Utinam), G. Laporte (OSU Theta), M. Pochard (SCD)
Correspondant dans chaque laboratoire
– Biogéosciences
– Chrono-environnement
– SMPCA (LICB)
– UTINAM
Chercheurs invités aux réunions
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- BBEES métadonnées Zone Atelier – mai 2014
- INIST équipe « Données de la recherche » - juin 2014
- Participations à des séminaires nationaux et internationaux
• Ecoscope
• AllEnvi
• RBDD
• ADBS, ADBU
• OV
• Datacite
• RDA
Contacts locaux et extérieurs
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Profil de métadonnées
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Validation du profil de métadonnées
Conception d'un premier formulaire de saisie et guide utilisateur tests
Test du profil de métadonnées auprès des équipes
Envoi du formulaire fin juillet
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Retours
Synthèse et étude des différents retours
12 fiches reçues :
- Hydrochimie
- Ecologie
- Spectroscopie
- Astronomie
→ Finalisation du modèle
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Titre Discipline Labo
Modern Land Snails from the Jura mountains Ecologie
HydraVitis Climatologie
HYCCARE-Bourgogne Climatologie
TEOM de Dédougou Metéorologie
Hydrochemical databases from Séchilienne unstable slope (French Alps)
Géosciences
Arvicola Ecologie
Grassland vegetation monitoring in the Jura Mountains Ecologie
Microma Indices 1990-2000 Ecologie
Jurassic Karst Géosciences
MeCaSDa, SheCaSDa and TFMeCaSDa databasesPhys.
moléculaire
TNO Astrometric database Astronomie
GAIASimu Universe Model Snapshot (GUMS) Astronomie
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Réunion bilan SRO
Présentation des résultats du SRO
– Modèle de métadonnées
– Document de description des métadonnées
– Communication
• En Direct (janvier 2015)
• Journée ADBS
• Conseil OSU
• Sites web (OSU, labos)
- Contacts
- Françoise Genova Directrice CDS, responsable OV France, RDA
- INIST, BBEES
- Tutelles : UFC-UB (journée ADBU)
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La suite du projet
Définition du profil
de métadonnées
Etude de
l’existant
Développement de
l’application
Collecte des
informations
Com
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Développement de l’application
Rédaction du cahier des charges (fin 2014 – mars 2015)
Développement des premières interfaces -Raphaël Melior (2015)
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Collecte des informations
• Saisie d’une fiche de métadonnées complète et valide : 1 à 2 heures
• Soutien au chercheur
documentaliste : CDD de 11 mois (Région, UFC, CNRS)
personne(s) référente(s) dans chaque laboratoire
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Sensibilisation et information des chercheurs
Sensibilisation et information des chercheurs
- Ateliers metadata party juillet 2015
- Formation à l’école doctorale : Introduction à la gestion et au partage des données de la recherche
- Page Web sur le projet
- Poster pour les laboratoires
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L’application
Base de données : Postgresql - Posgis
Langage : PHP
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Page d’accueil
Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » – Besançon, 3 et 4 décembre 2015 24 sur 28
Page d’accueil
Mots clés : nuage de points
Langue :
Aide :
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Conclusion
18 fiches complètes
Interfaces de consultation en cours de finalisation
Interfaces de saisie en cours
Export des métadonnées (interopérabilité)
Application destinée à être utilisée :
- En consultation : tout public
- En saisie : chercheurs
Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » – Besançon, 3 et 4 décembre 2015 28 sur 28
Conclusion
Travail commun : informaticien – chercheur –documentaliste
Gestion des données de la recherche : prochaines étapes ? Archivage à long terme, DMP, …