Programcsomag fejlesztése "multiplex microbead assay"

eredmények kiértékelésére

• Soft Flow Hungary Kft.

• 7628 Pécs, Kedves u. 24

Lustyik György

http://www.softflow.hu

Multiplex Mikrogyöngy Assay(MMA)

Orvosi, biológiai vizsgálati minta

Reagensek, különböző színű mikrogyöngyök

Reakció cella

MMultiplexultiplex MMicrobeadicrobead

AAssayssay

Fl

Klaszter azonosító fluoreszcencia

színek

Reporter fluoreszcencia

Minden szín-kombináció önálló klasztert alkotMinden klaszter más-más minta-komponens kimutatását végzi

Egy minta-komponens a mennyiségével (koncentrációjával) egyenesen arányos riporter fluoreszcenciát „gerjeszt”

Áramlási citométer cella

Fényszórás Fényszórás jelekjelek

Detektált jelek:

A klaszterek pozíciója alapján azonosítjuk a detektált minta-komponenst

Fényszórás jel (SSC, DD)Az összetapadt gyöngyök kiszűrésére SSC

Klaszter azonosító fluoreszcens színek (paraméterek)1 vagy 2 fluoreszcens szín, színenként 8-16 fluoreszcencia intenzitás kombinációi

C1 C2

Riporter paraméter(ek)A riporter paraméter intenzitásából történik az azonosított minta-komponens kvantitálása

R1

Assay Kit

Reagensekből, gyöngyök keverékéből és egyéb komponensekből álló készlet, amely alkalmas bizonyos számú vizsgálati minta analízisére.

Reagensek, mikrogyöngyökStandard mintákKontroll mintákA mérőkészülék ellenőrzésére szolgáló minták

Mérési és kiértékelési utasítás

Assay Specifikációs Fájlban (ASF) rögzített információ

Reakció cella

ASF-ben rögzített térfogatú vizsgálati minta

Standard mintákKontroll minták

Kísérleti mintákBetegek mintái

Egyéb minták

Assay Kit reagensek előírt mennyiségben összetételben

Az MMA technológia kivitelezése

96 cellás ELISA lemezek

Az eredmények kiértékelése:

1. Adatfájl/mérőkészülék tipus felismerése

2. Mérőkészülék beállítás, pontosság ellenőrzése

3. A mikrogyöngy klaszterek azonosítása4. A mikrogyöngy klaszterek és az Assay Kit által

determinált minta-paraméterek egymáshoz rendelése

5. Kalibrációs görbe (függvény) készítése

6. Koncentrációk kiszámítása

7. Riport dokumentum(ok) elkészítése

8. Kötelező mentések

1. Adatfájl/mérőkészülék tipus felismerésének szabályai

3. A mikrogyöngy klaszterek azonosításának szabályai

5. Kalibrációs függvény megadása

4. A mikrogyöngy klaszterek és az Assay Kit által determinált minta-paraméterek egymáshoz rendeléséhez szükséges adatok

2. Mérőkészülék beállítás, pontosságellenőrzéséhez szükséges adatok

Mentés ASF

6. Koncentrációk kiszámítása

7. Riport dokumentum(ok) elkészítése

8. Kötelező mentések

ASF információ

ASF

Assay specifikációs fájl (ASF) generálása az assay kit alapján

Kit gyártója

Kísérletek tervezése

Mérési eredmények kiértékelése

Eredmények riport formátumba foglalása

Kitek felhasználói

A program tervezése, megvalósítása az alábbi szervezetek, intézmények irányelvei alapján történt:

Task Force for Antigen Quantitation: European Working Group on Clinical Cell Analysis

Centers for Disease Control and Prevention (USA)

Laboratory Centere for Disease Control of Canada

National Committee on Clinical Laboratory Standards

International Federation of Clinical Chemistry

National Institute of Standards and Technology (USA)

A funkcionális és klinikai célú tesztelés a Laboratory Centere for Disease Control, Health Canada, Ottava közreműködésével valósul meg.

Assay Specifikációs Fájlok generálása

10plex Cytokin

Tplx.001

26NV01-001

10

y = a +{1 + ( ) } x

cd f

b

Kísérletek tervezése

Mérési eredmények kiértékelése

Eredmények riport formátumba foglalása

SAT Flow felhasználói szoftver

Assay specifikációs fájlok (ASF) importálása a SAT Flow programba

Új kísérlet tervezése

A mérőcellák, csövek fizikai elrendezése

Adatfájl – minta hozzárendelés

Riport dokumentum formátuma

Koncentráció – FL-intenzitás függvény illesztése

Eredmények, adatok megjelenítése

Hátralévő feladatok:

Funkcionális tesztelés

Kísérleti/klinikai tesztelés

Nyelvi modulok beépítése (pl. japán)

Report készítés pdf formátumban

A program tervezése és a programozás

Görömbey Péter programtervező matematikus

Torday Robert

Rácz Gábor

Smudla Antal

programozók lelkes munkája