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Exportación de datos a GBIF: - Servicio de alojamiento de datos de la Unidad de Coordinación - El modelo Darwin Core y su evolución - Exportar datos desde HERBAR Silvia Lusa Unidad de Coordinación GBIF-ES http :// www.gbif.es [email protected] ---------------------------------------------------------- - Taller de Herbar para usuarios avanzados 28-30 Septiembre 2005 Taller de HERBAR para usuarios avanzados

Silvia Lusa Unidad de Coordinación GBIF-ES gbif.es [email protected]

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Taller de HERBAR para usuarios avanzados. Exportación de datos a GBIF: - Servicio de alojamiento de datos de la Unidad de Coordinación - El modelo Darwin Core y su evolución - Exportar datos desde HERBAR. Silvia Lusa Unidad de Coordinación GBIF-ES http://www.gbif.es [email protected] - PowerPoint PPT Presentation

Text of Silvia Lusa Unidad de Coordinación GBIF-ES gbif.es [email protected]

  • Exportacin de datos a GBIF:

    - Servicio de alojamiento de datos de la Unidad de Coordinacin

    - El modelo Darwin Core y su evolucin - Exportar datos desde HERBAR

    Silvia LusaUnidad de Coordinacin GBIF-ES http://www.gbif.es [email protected] -----------------------------------------------------------Taller de Herbar para usuarios avanzados 28-30 Septiembre 2005Taller de HERBAR para usuarios avanzados

  • Servicio de Alojamiento.La Unidad de Coordinacin proporciona:

    El software necesario (DiGIR) para integrar los datos en la red de GBIF y/o espacio en disco. Dos opciones de uso:

    a./-Instituciones con servidor de base de datos disponible (Oracle, MS-SQLServer, MySQL) y que no quieran/puedan instalar, configurar y mantener un servidor DiGIR Conexin de nuestro DiGIR a una vista/tabla de su base de datos.

    b./-Instituciones sin servidor de base de datos (MS-Access). Espacio de disco en nuestros servidores para alojar la/s base/s de datos y conexin a nuestro DiGIR.Esta segunda opcin, es la utilizada por la mayora de los proveedores de datos de este servicio.

  • Servicio de Alojamiento.

    Para poder utilizar esta infraestructura , los proveedores de datos han de estar registrados

    La gestin y control de la base de datos, queda en manos del proveedor de datos. La/s base/s de datos de cada proveedor tendr/n entidad por s misma/s, esto es, sus registros no sern en ningn caso anexados a otros ni sern usados para otro fin que el de responder a las peticiones de las consultas de la red de GBIF.

  • Servicio de Alojamiento. Caractersticas tcnicas del servicio (caso de uso b.)

    Formato: la Unidad de Coordinacin puede alojar archivos de bases de datos tanto en MS-Access (extensin de archivo .mdb) como en MySQL (extensin .frm/.MYD/.MYI).

    Espacio en disco: cada Proveedor de datos podr disponer de un directorio con un espacio mximo de 250 Mb. El tamao de una base de datos depende del nmero de registros, pero a modo de ejemplo, unos 14.000 registros en MS-Access, ocupan aproximadamente 8.5 Mb. Estndar de datos utilizado: cada coleccin constar de una nica tabla formada por los campos definidos segn las especificaciones de DarwinCore versin 2:

  • Servicio de Alojamiento. Proceso a llevar a cabo por parte del Proveedor de Datos

    Peticin de solicitud de informacin a la Unidad de Coordinacinhttp:/www.gbif.es/Servicios.phpRecibo de e-mail con informacin acerca del servicio (subject: Informacin previa)http://www.gbif.es/Alojamiento/Alta (aceptacin del Acuerdo de Intercambio de Datos en la Red de GBIF)Opcin de uso a.(Institucin con servidor de base de datos)Opcin de uso b.(Institucin sin servidor de base de datos)

  • Recibo de e-mail con: (subject: Solicitud datos de configuracin)

    Datos de la cuenta para ftp Documento con instrucciones de instalacin y configuracin del programa cliente de ftp Documento (formulario) a rellenar con datos de configuracin necesariosEnvio de e-mail a la Unidad de Coordinacin con: Documento (formulario) completado con los datos de configuracin- Confirmacin de la transferencia de la base de datos a nuestros servidoresIntegracin de los datos alojados en el DiGIR de la Unidad de Coordinacin en la red de GBIF- Preparacin de tabla/vista DarwinCore2.

    Envo a la Unidad de Coordinacin de los datos del servidor necesarios para su conexin.

    Conexin y configuracin de DiGIR por parte de la Unidad de Coordinacin.Servicio de Alojamiento.

  • Servicio de Alojamiento.

  • Servicio de Alojamiento. Integracin de las bases de datos alojadas en la red GBIF

  • Darwin Core 2

    Para asegurar la interoperabilidad a la hora de consultar diferentes bases de datos de biodiversidad repartidas por todo el mundo es necesario tener una especificacin para datos de colecciones y observaciones de campo.

    Darwin Core2 es un estndar utilizado para el intercambio de datos.

    Esta formado por un conjunto de 48 elementos junto a sus definiciones

    Utilizado para colecciones y observaciones

    Permite que los datos sean estructurados como documentos XML y que stos puedan ser transmitidos a travs de Internet

    Constituye el formato de intercambio utilizado por DiGIR

    Esquema: http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/darwin2.xsd

    Versin no oficial en castellano.

  • Darwin Core 2* Indica los campos obligatorios. DateLastModified : Fecha y hora de la ltima modificacin del registro segn la norma ISO 8601. Va a ser el dato utilizado por el motor de indexacin del portal internacional. Cad vez que el portal indexa, se comprueba para cada registro si este dato ha sido modificado, en caso afirmativo lo reindexa de nuevo.