Upload
vuongdieu
View
217
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Lynettefællesskabet I/S Rapport
Marts 2012
Antibiotikaresistente bakterier i spildevand Undersøgelse af spredning fra Rigshospitalet til Renseanlæg Lynetten
This report has bred under the DHI Business Management System certified by DNV to comply with
ISO 9001: Quality Management System
Godkendt af:
13-03-2012
XApproved by
Signed by: Ulf Nielsen
i
Antibiotikaresistente bakterier i
spildevand
Undersøgelse af spredning fra Rigshospitalet til Renseanlæg Lynetten
Klient Lynettefællesskabet I/S
Klientens repræsentant Kim Rindel
Projekt nr. 11520009
Klassifikation Tilhører klienten
Forfattere Christine Anna Hastrup
Claus Jørgensen
Jette Wille Lentz Fredskilde
Ulf Nielsen
i
i DHI
INDHOLDSFORTEGNELSE
1 BAGGRUND ................................................................................................................. 1
2 FORMÅL ....................................................................................................................... 2
3 MÅLEPROGRAM .......................................................................................................... 3
3.1 Prøvetagningsprogram .................................................................................................. 3
3.1.1 Rigshospitalet ............................................................................................................... 3
3.1.2 Renseanlæg Lynetten ................................................................................................... 4
3.2 Analyseprogram ............................................................................................................ 5
3.2.1 Tabletmetoden .............................................................................................................. 7
3.2.2 E-Test (Epsilometer Test) ............................................................................................. 7
3.2.3 MALDI-TOF-MS ............................................................................................................ 7
3.2.4 Ribotypning ................................................................................................................... 7
4 RESULTATER OG DISKUSSION ................................................................................. 9
4.1 Forekomst af bakterier og resistens .............................................................................. 9
4.2 E. coli – ribotyper og resistensmønstre ....................................................................... 11
4.3 Klebsiella – ribotyper og resistensmønstre .................................................................. 14
5 KONKLUSION ............................................................................................................ 16
6 ANBEFALINGER ........................................................................................................ 17
7 REFERENCER ........................................................................................................... 18
BILAG A.................................................................................................................................... 23
BILAG B.................................................................................................................................... 25
BILAG C ................................................................................................................................... 27
BILAG D ................................................................................................................................... 29
BILAG E.................................................................................................................................... 31
BILAG F .................................................................................................................................... 33
ii DHI
1
1 BAGGRUND
Der har været et stigende forbrug af antibiotika i Danmark siden starten af 00’erne
(Statens Serum Institut, 2010). Et stigende antibiotikaforbrug medfører øget
antibiotikaresistens. Tidligere undersøgelser og måleprogrammer har vist, at
antibiotikaresistente bakterier forekommer i hospitalsspildevand, på renseanlæg, og i
vandmiljøet (Lynettefællesskabet, 2004; Lynettefællesskabet, 2007; Miljøstyrelsen,
2002). Hvis mennesker eksponeres for spildevand, er der en risiko for at blive inficeret.
Hvis der er tale om infektion med antibiotikaresistente patogene bakterier, kan
behandlingen besværliggøres eller i særligt uheldige tilfælde umuliggøres.
Baggrunden for dette projekt er et ønske om at undersøge spredningen af
hospitalsspecifik antibiotikaresistens til kloakker, renseanlæg og vandmiljø med henblik
på at forbedre datagrundlaget for at vurdere risikoen for at blive inficeret med
antibiotikaresistente bakterier. I Danmark bliver 10 % af humane antibiotika anvendt på
hospitaler (Statens Serum Institut, 2010). Der forekommer multiresistente bakterier på
hospitalerne. Hospitalernes antibiotikaforbrug giver samtidig et øget selektionspres,
hvor væksten af følsomme bakterier hæmmes, og væksten af modstandsdygtige
bakterier fremmes. Dette kan medføre, at antibiotikaresistente bakterier har en fordel
over for mere følsomme bakterier i spildevand med antibiotika.
For at undersøge, om antibiotikaresistens kan spores direkte tilbage til specifikke
hospitaler, er Rigshospitalet valgt som case. Infektionshygiejnisk Enhed (IHE) på
Rigshospitalet har opbygget en databank med ribotyper (rRNA-profiler) af alle
multiresistente E. coli og Klebsiella, som er identificeret på Rigshospitalet siden 2005.
E. coli eller Klebsiella betegnes som multiresistent, hvis den er resistent over for to af
følgende tre antibiotika: Gentamicin, cefuroxim og ciprofloxacin. Endvidere omfatter
databanken profilerne for de identificerede vancomycin-resistente enterokokker (VRE).
Ved sammenligning af ribotyper af antibiotikaresistente bakterier fundet i
Rigshospitalets spildevand, på Renseanlæg Lynetten og i Øresund med ribotyperne i
IHE’s databank vil det være muligt at vurdere, om den nedstrøms målte
antibiotikaresistens kan spores tilbage til Rigshospitalet. Nærværende projekt vil
dermed bidrage til mere viden omkring sammenhængen mellem hospitalerne og
antibiotikaresistens i vandmiljøet.
2
2 FORMÅL
Formålet med undersøgelsen er at screene for spredningen af hospitalsspecifik
antibiotikaresistens fra hospitaler til renseanlæg og vandmiljø. Der arbejdes konkret
med Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten, som Rigshospitalet afleder til. Samtidig
undersøges forekomsten af vancomycin-resistente enterokokker på renseanlæg og i
vandmiljø. Herunder er det formålet at:
udtage prøver fra henholdsvis Rigshospitalet, Renseanlæg Lynetten og Øresund
identificere og isolere antibiotikaresistente bakterier fra de tre lokaliteter
anvende ribotypning til kortlægning af rRNA-profiler af de fundne
antibiotikaresistente bakterier
sammenligne rRNA-profilerne af de fundne antibiotikaresistente bakterier med
rRNA-profiler i Rigshospitalets databank for at afklare, om de fundne
antibiotikaresistente bakterier kan spores tilbage til Rigshospitalet.
3
3 MÅLEPROGRAM
3.1 Prøvetagningsprogram
Der er taget prøver fra følgende tre lokaliteter:
Rigshospitalet
Renseanlæg Lynetten
Kongedybet i Øresund
3.1.1 Rigshospitalet Der blev udtaget spildevandsprøver fra Rigshospitalet tirsdag den 30. august 2011
mellem kl. 10.00 og kl. 10.30. Prøverne blev taget i brønden på
personaleparkeringspladsen langs Blegdamsvej (markeret med en stjerne på Figur 3-1).
Figur 3-1 Kort over Rigshospitalets område, hvor prøvetagningsbrønden er markeret med en stjerne. Bygninger, der afleder spildevand til prøvetagningsbrønden, er markeret med pile til prøvetagningsbrønden. Det originale billede er udlånt af Rigshospitalet.
Pumper, der afleder regn- og drænvand til prøvetagningsbrønden, blev standset under
prøvetagningen. Det forventes dermed, at prøverne udelukkende består af sanitært
spildevand.
Fordelingen af spildevand, der afledes til prøvetagningsbrønden, er ifølge teknisk
personale på Rigshospitalet estimeret til ca. 90% fra centralbygningen, sydbygningen og
mellembygningen og ca. 10 % fra epidemi- og infektionsafdelingen (stiplet linje).
Der blev udtaget ialt ca. 30 liter spildevand. Spildevandet blev efter prøvetagning
sammenblandet i forholdet 90:10, jf. ovenstående.
Figur 3-2 viser prøvetagningsbrønden.
4
Figur 3-2 Billede af prøvetagningsbrønden ved Rigshospitalet med prøvetagningsudstyr.
3.1.2 Renseanlæg Lynetten Der blev udtaget tre prøver fra Renseanlæg Lynetten: Én fra indløbet, én fra indløbet til
biologisk rensning og én fra udløbet. Vand fra indløbet til biologisk rensning er primært
renset, men ikke biologisk renset, og i tilfælde af højt flow med overløb vil vandet fra
indløbet til biologisk rensning være sammenligneligt med overløbsvandet, da overløb
sker efter primær rensning.
Prøverne blev taget som flowproportionelle døgnprøver fra kl. 9 den 29. august 2011 til
kl. 9 den 30. august 2011. Hver prøve blev taget i en PE-dunk med et volumen på 5
liter. Prøverne blev opbevaret på køl.
Der var flere kraftige regnbyger i Københavnsområdet i prøvetagningsperioden.
3.1.3 Kongedybet, Øresund Sedimentprøver blev indsamlet i Kongedybet i Øresund tæt på udløbet fra Renseanlæg
Lynetten. Indsamlingen fandt sted den 29. august 2011. Sedimentet blev indsamlet fra
en RHIB (Rigid-Hulled Inflatable Boat) ved brug af en grab i 6,8 meters dybe. Punktet,
hvor sedimentet blev indsamlet, har koordinaterne N55º41.761’ E012º38.890’. Dette
punkt er cirka 200 meter fra udløbet fra Lynetten.
Muslingerne blev indsamlet i en 10-liters plastspand ca. 50 meter fra punktet, hvor
sedimentet blev indsamlet. Efter indsamling blev muslingerne transporteret til DHIs
laboratorier i plastspanden, hvorefter muslingerne blev renset og skallerne fjernet.
5
Figur 3-3 Kort over København og Kongedybet i Øresund (Eniro/Krak, 2011). Prøvetagningsstedet for sediment og muslinger er markeret med rødt.
3.2 Analyseprogram
Analyser blev udført i DHIs laboratorier samt på IHEs laboratorier på Rigshospitalet.
Resistensbestemmelserne omfattede tre typer af testbakterier: Escherichia coli,
Klebsiella pneumoniae og enterokokker. Protokoller for bestemmelserne fremgår af
Bilag A-C. Der blev i alt analyseret for resistens over for fem antiobiotika. Tabel 3-1 er
en oversigt over antibiotika og testbakterier anvendt i analyserne.
Tabel 3-1 Antibiotika og tilhørende anvendelsesområder samt testbakterier og anvendte breakpoints for hvert antibiotikum
Antibiotikum Anvendelse Testbakterie(r) Breakpoint
[µg/ml]1
Ciprofloxacin Hospitaler og
primærsektor
E. coli og
Klebsiella 1
Cefuroxim Hospitaler E. coli og
Klebsiella 8
Gentamicin Hospitaler E. coli og
Klebsiella 4
Meropenem Hospitaler E. coli og
Klebsiella 8
Vancomycin Hospitaler Enterokokker 4
1. (EUCAST, 2011)
For spildevandsprøverne fra Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten blev der testet for
resistens for alle tre typer testbakterier.
Bestemmelse af ”suspekte E. coli” blev gennemført ved spredning af spildevandsprøven
i triplikat på Oxoid Brilliance agar, der er en selektiv agar for coliforme bakterier. Alle
violette kolonier blev talt som ”suspekte E. coli”, idet der ikke blev gennemført
yderligere verifikation af de enkelte kolonier. Brilliance agaren var enten uden
antibiotika eller med antibiotika, henholdsvis ciprofloxacin (1 mg/l), gentamicin (4
6
mg/l) og cefuroxim (8 mg/l). De angivne koncentrationer af ciprofloxacin, gentamicin
og cefuroxim er breakpoints, og bakteriekolonier dyrket ved eller over denne
antibiotikakoncentration må anses for at være resistente (EUCAST, 2011).
For bestemmelse af ”suspekte Klebsiella” blev der spredt spildevandsprøve i enkelt
udsæd på blodagar og i dobbelt udsæd på HiCromeTM
agar, en selektiv agar for
Klebsiella. For begge typer agar blev der lavet plader uden antibiotika samt plader med
Ciprofloxacin (1 mg/l), Gentamicin (4 mg/l) og Cefuroxim (8 mg/l) tilsat agaren. Alle
lilla-mangenta røde kolonier blev talt som ”suspekte Klebsiella”.
Figur 3-4 Billede af E. coli, coliforme og ikke coliforme bakterier dyrket på Oxoid Brilliance agar. Foto: DHI.
For at teste for multiresistens blev der udvalgt fem E. coli og Klebsiella fra hver plade
med henholdsvis ciprofloxacin, gentamicin og cefuroxim. De udvalgte kolonier blev
overført til nye agarplader, en plade pr. koloni. Kolonierne blev testet for Ciprofloxa-
cin-, Gentamicin-, Cefuroxim- og Meropenemresistens ved tabletmetoden. MALDI-
TOF-MS blev brugt til artsbestemmelse. Udvalgte isolater blev ribotypet og E-testet.
For bestemmelse af suspekte Enterokokker blev der spredt prøve i duplikat på Slanezt
agar uden antibiotika samt på agar med Vancomycin (4 mg/l). Der blev testet for
Vancomycinresistens ved tabletmetoden, og artsbestemmelse blev gennemført med
MALDI-TOF-MS. Udvalgte isolater blev ribotypet og E-testet.
For muslingeprøverne blev muslingekødet blendet i et våd vægt:volumen forhold på
1:10. Bakterier blev dyrket i MacConkey bouillon uden antibiotika samt med
henholdsvis Ciprofloxacin (1 mg/l), Gentamicin (4 mg/l) og Cefuroxim (8 mg/l).
Samme procedure blev fulgt for sedimentprøverne.
Violet: E. coli
Pink: coliform
Blå: Ej coliform eller E. coli
7
3.2.1 Tabletmetoden Tabletmetoden bruges til bestemmelse af resistens over for forskellige antibiotika.
Tabletmetoden er baseret på diffusion af antibiotika i agar.
Resultaterne af tabletmetoden er for hvert antibiotikum enten følsom, intermediær eller
resistent. Hvis resultatet er følsom, betyder det, at bakterien ikke har nogen påviste
resistensmekanismer mod det pågældende antibiotikum. I medicinsk forstand betyder
følsom, at antibiotikummet forventes at have virkning ved standarddosis. Hvis resultatet
er intermediær, betyder det, at bakterien har nedsat følsomhed over for det pågældende
antibiotikum. Medicinsk kan dette betyde, at stoffet evt. kræver en højere dosering, eller
at stoffet opkoncentreres på infektionsstedet. Hvis resultatet er resistent, betyder det, at
bakterien har en til flere resistensmekanismer, som gør, at bakterien ikke påvirkes af det
pågældende antibiotikum. Dette bevirker, at en infektion med denne bakterie ikke vil
kunne behandles med det pågældende antibiotikum (Dansk Selskab for Klinisk
Mikrobiologi, 2004).
3.2.2 E-Test (Epsilometer Test) E-test bruges til at fastlægge MIC-
koncentrationen for bakterier. Testen består af
en plastikstrip påført antibiotika i stigende
koncentration ned langs længden af strippen.
Strippen placeres på en agarplade og inkuberes.
Der opstår en hæmningszone omkring strippen,
som vist på Figur 3-5. MIC (Minimum
Inhibition Concentration) værdien aflæses
direkte på strippen og angiver den laveste
antibiotika koncentration, der skal til for at
hæmme bakteriernes vækst (Dansk Selskab for
Klinisk Mikrobiologi, 2004).
3.2.3 MALDI-TOF-MS MALDI-TOF-MS er i dette studie brugt til artsbestemmelse af bakterier baseret på
proteiner. Det er en koblet analysemetode bestående af tre dele: MALDI (Matrix
Assisted Laser Desorption Ionization), TOF (Time of Flight) og MS (Mass
Spectrometry). Proteiner fra de bakterier, der ønskes artsbestemt, ekstraheres og
indlejres i en matrix. Matrixen beskydes med en laserstråle, hvis energi bevirker, at
proteinmolekyler ioniseres. Efterfølgende accelereres proteinmolekylerne i et elektrisk
felt. De ioniserede molekylers forskellige masser gør, at forskellige molekyler får
forskellige hastigheder, som registreres og danner et spektrum. Spektret er specifikt for
den pågældende mikroorganisme, som identificeres ved sammenligning med kendte
referencespektre i en database (OUH, 2009).
3.2.4 Ribotypning Ribotypning er en metode, der anvendes til at identificere bakteriestammer. Metoden
virker ved, at en bakteriestamme isoleres, og der ekstraheres genomisk DNA. DNA’et
kappes med et restriktionsenzym og separeres ved gelelektroforese. 16S og 23S rRNA
bruges som probe. Gelen fotograferes og analyseres digitalt på en computer, hvor
billedet sammenlignes med tidligere undersøgte bakterier i en database. Ribotypen er
således en slags fingeraftryk, der fortæller om DNA’et som koder for rRNA.
Figur 3-5 Eksempel på agarplade med E-test (kilde: Wikipedia)
8
Ribotypning anvendes som fast procedure på Rigshospitalet, udført af
Infektionshygiejnisk Enhed, ved udredning af infektionsudbrud samt ved overvågning
af særlige bakterietyper i forbindelse med eventuel spredning af infektioner og analyse
til sammenligning af resistente bakterier (Infektionshygiejnisk Enhed, 2007).
9
4 RESULTATER OG DISKUSSION
4.1 Forekomst af bakterier og resistens
Der blev fundet multiresistente bakterier (resistente for mindst to antibiotika) i
spildevandsprøverne, mens de hverken blev fundet i sedimentprøverne eller i
muslingerne. De følgende resultater er derfor kun for spildevandsprøverne. Tabel 4-1
viser de fundne koncentrationer af suspekte E. coli, suspekte Klebsiella, suspekte
enterokokker og coliforme bakterier i spildevandsprøverne.
Tabel 4-1 Total koncentration af suspekte E. coli, suspekte Klebsiella, suspekte enterokokker og coliforme bakterier i spildevandet fra hvert prøvetagningssted samt koncentrationen af hver type bakterie resistent over for udvalgte antibiotika fra hvert prøvetagningssted.
Bakterie Prøve-
tagningssted
Total
Ciprofloxacin
resistente
bakterier
Cefuroxim
resistente
bakterier
Gentamicin
resistente
bakterier
Vancomycin
resistente
bakterier
[kim/ml] [kim/ml] % [kim/ml] % [kim/ml] % [kim/ml]
E. coli
Rigshospitalet 22.700 7.140 31 1.050 5 1.090 5 -
RL tilløb 31.800 1.270 4 1.000 3 1.320 4 -
RL tilløb bio 40.100 1.730 4 1.180 3 909 2 -
RL udløb 1.550 59 4 55 4 55 4 -
Klebsiella
Rigshospitalet 39.500 10.200 26 16.000 41 10.000 25 -
RL tilløb 69.400 2.270 3 2.180 3 1.070 2 -
RL tilløb bio 49.500 1.770 4 1.910 4 1.800 4 -
RL udløb 2.880 82 3 64 2 82 3 -
Coliforme
Rigshospitalet 50.900 14.500 28 9.460 19 6.270 12 -
RL tilløb 89.600 2.720 3 2.820 3 1.729 2 -
RL tilløb bio 93.700 2.820 3 2.950 3 1.409 2 -
RL udløb 5.500 104 2 105 2 100 2 -
Enterokok-
ker
Rigshospitalet 39.100 - - - (5)
RL tilløb 26.600 - - - (27)
RL tilløb bio 1.080 - - - (< 5)
RL udløb 2.910 - - - (36)
( ) Kolonier kunne ikke verificeres som enterokokker på IHE
Der ses en tendens til, at koncentrationen af total kimtal er lavere i spildevandet fra
Rigshospitalet end i tilløbet til Renseanlæg Lynetten, mens den laveste koncentration
blev observeret i det rensede spildevand. Renseeffektiviteten over renseanlægget for de
målte bakterier ligger omkring 95%. En rensningsgrad på 95% ses ofte, men
rensningsgrader på > 99% er ikke udsædvanlige (Erichsen et al., 2006).
Der er generelt fundet flere suspekte Klebsiella end suspekte E. coli. Klebsiella og E.
coli tilhører begge gruppen af coliforme bakterier. Summen af E. coli og Klebsiella
burde derfor være mindre end eller lig med koncentrationen af totale coliforme
bakterier. Generelt var der god overensstemmelse, idet niveauerne var ens, som det
10
fremgår af Tabel 4-1. Dog ses det, at for mange af prøverne er summen af suspekte
Klebsiella og suspekte E. coli lidt højere end koncentrationen af totale coliforme (13%
til 92% højere). Det skyldes, at selektiviteten af de anvendte agar er forskellig, og at
man derfor ikke umiddelbart kan sammenligne tallene. Endvidere kan det skyldes, at
nogle af de suspekte Klebsiella og de suspekte E. coli ikke var Klebsiella eller E. coli.
Det ses også, at der generelt var flere resistente bakterier i spildevandsprøverne fra
Rigshospitalet end i prøverne fra Renseanlæg Lynetten. Koncentrationen af resistente
bakterier i Renseanlæg Lynettens tilløb og tilløb til biologisk rensning var nogenlunde
ens, mens den laveste koncentration blev målt i udløbet. Andelen af resistente bakterier
i tilløb og udløb fra Lynetten var 2% til 4%, mens andelen af resistente bakterier var
væsentligt højere i spildevandet fra Rigshospitalet (12% til 31%) med undtagelse af
cefuroxim og gentamicin resistente suspekte E. coli, hvor kun 5% var resistente.
De resistente bakterier, der findes i spildevandet, kommer enten fra inficerede patienter,
er dannet i kloakken ved celledeling (vertikal overførsel) eller ved udveksling af
genetisk materiale mellem bakterier (horisontal overførsel). Ved en intensiv anvendelse
af antibiotika forventes der at ske en selektion af resistente bakterier, så en større andel
af patienterne udskiller resistente bakterier til spildevandet. Ved en høj koncentration af
antibiotika i spildevandet forventes det, at resistente bakterier vil have en
konkurrencemæssig fordel og dermed have en forøget koncentration og procentvis
andel. En stor andel af de antibiotika, der anvendes i oplandet til Renseanlæg Lynetten,
bliver brugt på Rigshospitalet (se Tabel 4-2). Dette stemmer overens med, at de højeste
andele af resistente bakterier blev fundet ved Rigshospitalet. Desuden ses det, at andelen
af resistente bakterier generelt var højest for cefuroxim og ciprofloxacin, hvilket
stemmer med, at forholdet mellem den beregnede koncentration af antibiotikum i
spildevandet set i forhold til breakpoint koncentration var højest for disse.
Tabel 4-2 Forbrug og beregnet spildevandskoncentration af de antibiotika, der er anvendt i studiet (DHI 2011). Tabellen viser endvidere antibiotikakoncentrationen i de agar, som er anvendt til tællingerne (breakpoint), samt forholdet mellem beregnet antibiotikakoncentration i spildevandet og forholdet mellem beregnet antibiotikakoncentration (Rigshopitalet og Renseanlæg Lynetten) og koncentration i agar.
Antibiotikum
Forbrug
RH
Forbrug
RL
opland
Forbrug
RH
Konc.
spildevand
RH
Konc.
tilløb RL
Konc
agar
*Spildevand
(RH)/Agar
*Spildevand
(RL)/Agar
(kg/år) (kg/år) % (µg/l) (µg/l) (µg/l) % %
Cefuroxim 156 276 56 646 4,7 8000 8 0,1
Gentamicin 0,9 2,3 38 3,6 0,04 4000 0,1 0,001
Ciprofloxacin 51 184 28 211 3,1 1000 21 0,3
Meropenem 74,7 89 84 310 1,5
*Den beregnede koncentration i spildevandet/koncentrationen i agar benyttet til tælling
På baggrund af prøvetagninger er det ikke muligt at vurdere indholdet af multiresistente
bakterier opstrøms Rigshospitalet. Det er muligt, at nogle patienter inficeret med
multiresistente bakterier på Rigshospitalet forlader hospitalet, mens de stadig bærer
multiresistente bakterier. Dette vil medføre, at den multiresistente bakteriestamme både
vil være til stede i Rigshospitalets spildevand og i husspildevandet fra patientens hjem.
Der blev ikke fundet vancomycin resistente enterokokker i spildevandet.
11
4.2 E. coli – ribotyper og resistensmønstre
Tabel 4-3 viser resultaterne af resistensbestemmelser gennemført af IHE af E. coli i
spildevandprøverne. Der blev analyseret 15 stammer fra hver af de fire
spildevandsprøver. Hver spildevandsprøve blev spredt på tre agarplader tilsat
antibiotika, henholdsvis ciprofloxacin, cefuroxim og gentamicin, for at selektere for
resistente stammer. Fra hver agarplade blev der udtaget fem E. coli stammer. Hver
stamme blev rendyrket på en ny agarplade, og resistens over for ciprofloxacin,
cefuroxim, gentamicin og meropenem blev testet ved tabletmetoden. Resultatet F er
markeret med grøn skrift og indikerer en følsom stamme, I er markeret med gul skrift
og indikerer en intermediær stamme, og R er markeret med rød skrift og indikerer en
resistent stamme.
Det ses, at de stammer, der er isoleret fra agarplader tilsat ciprofloxacin, alle er bestemt
til at være ciprofloxacinresistente. Det samme gælder for cefuroxim. For gentamicin er
prøven fra RL tilløb en undtagelse, idet alle stammer er følsomme over for gentamicin.
Det formodes, at der er tale om en laboratoriefejl, idet stammer fremdyrket på en
agarplade med gentamicin burde være resistente overfor gentamicin.
Tabel 4-3 Resistensmønstre for de 15 dyrkede E. coli stammer fra spildevandsprøverne fra henholdsvis Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. F betyder, at stammen er følsom, I betyder intermediær og R betyder resistent.
Rigshospitalet RL tilløb RL tilløb bio. RL udløb
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
Dyrket på plade
med
ciprofloxacin
R F F F R R F F R F F F R R F F
R F F F R F R F R R F F R R F F
R F F F R F F F R R F F R F R R
R F F F R F F F R R F F R F F R
R F F F R I F F R R F F R F F R
Dyrket på plade
med cefuroxim
F R R F F R F F R R F F R R F F
F R R F R R F F F R F F F I F F
F R R F R R F F R R R F F R F F
R R R F F R F F R R F F R R F F
R R R F R R F F F R F F F R F F
Dyrket på plade
med gentamicin
F F R F F I I F F R R F F F R F
F I R F F F F F R F R F F I R F
F F R F F F F F R F R F F I R F
R R R F F F F F F R R F R F R F
R R R F F F F F F I R F
12
Der blev fundet 7 multiresistente E. coli stammer med 4 forskellige resistensmønstre på
Rigshospitalet, 3 multiresistente E. coli stammer med 3 forskellige resistensmønstre i
tilløbet til Lynetten, 11 multiresistente E. coli stammer med 5 forskellige
resistensmønstre i tilløbet til biologisk rensning og 7 multiresistente E. coli stammer
med 4 forskellige resistensmønstre i udløbet fra Lynetten. 16 multiresistente E. coli
stammer blev udvalgt til ribotypning. De ribotypede stammer er markeret med en grå
kasse i Tabel 4-3.
Resultaterne af ribotypningen af de udvalgte E. coli stammer er vist i Tabel 4-4. Af de
16 ribotypede E. coli stammer var der 10 forskellige ribotyper. 9 af de 10 ribotyper var i
forvejen kendt og en del af Rigshospitalets databank, hvilket betyder, at de tidligere er
forekommet på Rigshospitalet. Den ene ukendte ribotype blev fundet i tilløbet til
biologisk rensning på RL og blev tildelt ribotypenummeret 876-S6.
Ribotype 70-S4 blev identificeret i spildevandet fra tilløbet til RL og i tilløbet til
biologisk rensning på RL. Selvom ribotypen er den samme, viser Tabel 4-4, at de
analyserede E. coli stammer har forskellige resistensmønstre.
Ribotype 129-S1 blev identificeret i spildevandsprøverne fra alle fire
prøvetagningssteder, henholdsvis Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk
rensning på RL og udløb fra RL. Alle fire 129-S1 stammer har forskellige
resistensmønstre.
Tabel 4-4 Ribotyper for de analyserede multiresistente E. coli fundet i spildevandet fra Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. Resistens over for Ciprofloxacin, Cefuroxim, Gentamicin og meropenem er også vist. F betyder følsom, I betyder intermediær, og R betyder resistent. De ribotyper, der er identificeret fra mere end et prøvetagningssted, er markeret med fed skrift.
Prøvetagningssted
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
Ribotype
Rigshospitalet
F R R F 70-S3
F R R F 129-S1
R R R F 163-S2
R R R F 163-S2
RL tilløb
R F R F 70-S4
R R F F 70-S4
R R F F 129-S1
RL tilløb bio
R R F F 70-S4
F R R F 125-S2
R F R F 129-S1
R R R F 104-S1
R F R F 876-S6
13
RL udløb
R R F F 71-S2
R R R F 129-S1
R R F F 424-S2
R F R F 166-S7
På den ene side indikerer fundet af en multiresistent E. coli ribotype 129-S1 i alle
prøverne, at multiresistente E. coli fra Rigshospitalet kan nå Renseanlæg Lynetten og
blive udledt, enten gennem renseanlægget eller i forbindelse med en overløbshændelse.
På den anden side indikerer forskellene i deres resistensmønstre, at de fundne E. coli
type 129-S1 stammer fra forskellige kilder.
Ribotypning er baseret på forskelle i den DNA, der koder for de ribosomale subunits
5S, 16S og 23S. Det betyder, at der godt kan være forskelle i den øvrige del af det
kromosomale DNA, selvom ribotypen er den samme. Desuden kan samme ribotype
bære plasmider med forskellige resistensegenskaber. Derfor kan to stammer af samme
ribotype have forskellige resistensmønstre. Det er f.eks. vist for quinolone kromosomalt
båret (GyrA) resistens i Clostridium dificile (Carman et al., 2009).
Kromosomalt bårne resistensegenskaber ændrer sig ikke over kort tid, da det kræver en
mutation. Der kan dog være hurtige fænotypiske ændringer, da den resistente egenskab
ikke udtrykkes under alle forhold (se Schreiber, 2011), men det forventes, at
dyrkningsforholdene ved resistensbestemmelserne er ensartet, så de fænotypiske
ændringer ikke vil blive detekteret med de metoder, der er anvendt i nærværende studie.
Kromosomalt bårne resistensegenskaber forventes derfor ikke at ændre sig på den korte
tid, der er mellem Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten. Derimod kan plasmidbårne
resistensegenskaber ændre sig over relativt kort tid ved horizontal overførsel mellem
bakterier. F.eks. beregnede Marcinek et al. (1998), at der skete mellem 104 og 10
8
plasmidoverførsler pr. 4 timer i et renseanlæg. Der er derfor sandsynligt, at der sker en
ændring af de plasmidbårne resistensegenskaber mellem Rigshospitalet og
Renseanlægget.
Resistens over for ciprofloxacin, cefuroxim, gentamicin og meroponem kan både være
båret kromosomalt og ved plasmider (Schumacher et al., 1996; Suh Yah. 2010; Center
for Disease Control, 2010; Cheung et al., 2005; Fujisawa-Kon et al., 1981, Kaufhold &
Potgieter, 1993). Det betyder, at resistensmønstrene i princippet godt kan ændre sig på
vej ned igennem kloaksystemet ved horisontal overførsel af plasmider.
Det er også muligt at samme ribotype har eksisteret på Rigshospitalet med forskellige
ribotyper. Ved opslag i Rigshospitalets database kan det ses, at der fra januar 2008 til
december 2011 har været identificeret 90 isolater af E. coli ribotype 129-S1. De 90
isolater har et varierende resistensmønster, hvilket tyder på, at det er en klon, der har
været længe på Rigshospitalet, eller som muterer hurtigt (Andersen, 2012).
Det konkluderes, at der er fundet multiresistente E. coli ribotype 129-S1 ved alle
prøvetagningssteder. Da de har forskellige resistensmønstrer, er det sandsynligt, at de E.
coli ribotype 129-S1, der er fundet ved Renseanlæg Lynetten, ikke er de samme som de,
der er fundet ved Rigshospitalet. Men det kan ikke udelukkes, at det er de samme, da
resistensmønstret kan ændre sig på vejen gennem kloaksystemet.
14
4.3 Klebsiella – ribotyper og resistensmønstre
Tabel 4-5 viser resistensmønstre for Klebsiella stammer dyrket fra spildevandsprøverne
fra Rigshospitalet og indløbet til RL. Der blev ikke isoleret nogle resistente Klebsiella
stammer i spildevandet fra indløbet til biologisk rensning på RL eller i udløbet fra RL.
Der blev generelt ikke fundet lige så mange multiresistente Klebsiella stammer som
resistente E. coli stammer. Der var 10 multiresistente Klebsiella stammer fra
spildevandsprøven fra Rigshospitalet med 3 forskellige resistensmønstre. Der var 2
multiresistente Klebsiella stammer fra spildevandet fra tilløbet til RL, og begge
stammer havde samme resistensmønster. De multiresistente Klebsiella stammer, der
blev udvalgt til ribotypning, er markeret med en grå kasse i Tabel 4-5.
Tabel 4-5 Resistensmønstre for de 10 dyrkede Klebsiella stammer fra spildevandsprøven fra Rigshospitalet og de to stammer fra tilløb til RL.
Rigshospitalet RL tilløb
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
Fra agarplade
med
ciprofloxacin
R R R F R R F F
R R R F R R F F
R I R F
R R R F
R R R F
Fra agarplade
med cefuroxim I R R F
Fra agarplade
med gentamicin
R R R F
R R R F
R R R F
R R R F
Resultaterne af ribotypningen af de udvalgte Klebsiella stammer er vist i Tabel 4-6. Der
blev fundet tre ribotyper ialt. To af de tre udvalgte stammer fra Rigshospitalet havde
samme ribotype, 876-S1.
15
Tabel 4-6 Ribotyper for de analyserede multiresistente Klebsiella fundet i spildevandet fra Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. Resistens over for ciprofloxacin, cefuroxim, gentamicin og meropenem er også vist. F betyder følsom, I betyder intermediær, og R betyder resistent.
Prøvetagningssted
cip
rofl
ox
acin
cefu
rox
im
gen
tam
icin
mer
op
enem
Ribotype
Rigshospitalet
R R R F 876-S1
I R R F 876-S1
R R R F 233-S7
RL tilløb R R F F 111-S6
16
5 KONKLUSION
Hovedkonklusion af nærværende projekt er, at det ikke kan udelukkes, at de
multiresistente bakterier fundet ved Renseanlæg Lynetten stammer fra Rigshospitalet.
Konklusionerne kan opdeles baseret på testbakterierne E. coli, Klebsiella og
enterokokker.
For E. coli blev 16 stammer udvalgt til ribotypning. Samme ribotype, 129-S1, blev
fundet ved alle fire prøvetagningssteder, både på Rigshospitalet og Renseanlæg
Lynetten. Der er således mulighed for, at resistente bakterier af denne ribotype ved
Renseanlæg Lynetten er kommet fra Rigshospitalet. Bakterierne med ribotype 129-
S1 fra de fire prøvetagningssteder har dog alle forskellige resistensmønstre, hvilket
vil sige, at de er resistente for forskellige antibiotika. Stammerne er således ikke
ens, selvom de har samme ribotype.
Forskellen i resistensmønstre kan skyldes flere ting. Det er muligt, at bakterierne
har fået/tabt resistensegenskaber over for visse antibiotika via overførsel med andre
bakterier i kloaksystemet. Det er også muligt, at samme ribotype er forekommet på
Rigshospitalet med forskellige resistensmønstre.
Der blev udvalgt 4 Klebsiella stammer til ribotypning, tre fra Rigshospitalets
spildevand og én fra tilløbet til Renseanlæg Lynetten. Ribotypen fra tilløbet til RL
var forskellig fra ribotyperne identificeret i Rigshospitalets spildevand.
Der blev ikke fundet vancomycinresistente enterokokker.
Dertil kan tilføjes, at det kun er et begrænset antal stammer, der er udvalgt til ribotypning. Det er
muligt, at der har været andre ribotyper, som er forekommet ved mere end et af
prøvetagningsstederne, men som bare ikke er blevet identificeret.
17
6 ANBEFALINGER
For at få mere viden omkring kilder til multiresistente bakterier i oplandet til
Renseanlæg Lynetten kræves videre undersøgelser af spildevandet i oplandet til
renseanlægget. Metoden med ribotypning af multiresistente stammer kan ikke
fastlægge, hvorfra en bestemt bakterie stammer. Metoden kan derimod påvise, at en
stamme fundet ved renseanlægget er den samme som en stamme identificeret ved en
specifik kilde (i dette tilfælde Rigshospitalet). Resultaterne af nærværende studie har på
denne måde vist, at der er en vis sandsynlighed for, at nogle af de multiresistente
bakterier fundet ved Renseanlæg Lynetten stammer fra Rigshospitalet. Resultaterne kan
dog ikke udelukke, at de multiresistente stammer fundet ved renseanlægget kommer fra
andre kilder i oplandet, da indholdet af multiresistente bakterier og deres ribotyper ikke
kendes for f.eks. husspildevand.
Det videre arbejde med sporing af resistens i oplandet til Renseanlæg Lynetten
anbefales at indeholde prøvetagning af spildevand flere steder i oplandet samt
efterfølgende ribotypning af fundne multiresistente stammer. Prøver af spildevand taget
opstrøms fra Rigshospitalet vil belyse indholdet af multiresistente bakterier og deres
ribotyper i spildevand uden påvirkning af et hospital. Sammen med prøver fra
Rigshospitalet vil det være muligt at lave en sammenligning, der giver et billede af, om
der er visse ribotyper, der primært er hospitalsspecifikke, og om der generelt er stor
forskel på indholdet af multiresistente bakterier i hospitalsspildevand og husspildevand.
Flere prøver vil gøre det muligt mere nøjagtigt at bedømme, om Rigshospitalet er en
betydelig kilde til multiresistente bakterier på Renseanlæg Lynetten.
En fremtidig undersøgelse kunne også indeholde prøvetagning og ribotypning af
multiresistente bakterier i spildevand fra andre hospitaler i oplandet for at belyse, om de
ribotyper, der er kendt fra Rigshospitalet, er specifikke for Rigshospitalet, eller om de er
fælles for hospitaler generelt.
18
7 REFERENCER
Andersen, L. P., 2012
Personlig kommunikation om tidligere forekomst af ribotyper på Rigshospitalet
Carman R. J., Genheimer, C. W., Rafii, F., Park, M., Hiltonsmith, M. F. & Lyerly, D.
M., 2009
Diversity of moxifloxacin resistance during a nosocomial outbreak of a predominantly
ribotype ARU027 Clostridium difficile diarrhea
Anaerobe, 15, s. 244-248
Center for Disease Control, 2010
Laboratory Detection of Imipenem or Meropenem Resistance in Gram-negative Organ-
isms
http://www.cdc.gov/HAI/settings/lab/lab_imipenem.html#a5
Cheung, T. K. M., Wai Chu, Y., Yu Chu, M., Ha Ma, C., Hung Yung, R. W. & Man
Kam, K., 2005
Plasmid-mediated resistance to ciprofloxacin and cefotaxime in clinical isolates of Sal-
monellsa enterica serotype Enteritidis in Hong Kong
Journal of Antimocrobial Chemotherapy, 56, s. 586-589
Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologi, 2004
Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologis referencegruppe vedrørende antibiotika
resistensbestemmelse- Klaringsrapport
http://www.dskm.dk/pdf/rapporter/DSKM-rapporter/klaringsrapport-RETTET.pdf
DHI, 2011
Pharmaceuticals Database
Eniro/Krak, 2011
Kort over København og Øresund
http://map.krak.dk/
Erichsen, A.E., Kaas, H., Dannisøe, J., Mark, O. og Jørgensen, C., 2006
Etablering af badevandsprofiler og varslingssystemer i henhold til EU's nye
badevandsdirektiv
Miljøprojekt Nr. 1101
EUCAST, 2011
Data from the EUCAST MIC distribution website
European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing
http://eucast.org
Fujisawa-Kon, N., Ike, Y., Shimizu, S. Motohashi, K., Hashimoto, H. & Mitsuhashi, S.,
1981
Identification of R plasmids mediating gentamicin resistance from Escherichia coli
strains in Japan
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 19(6), s. 1070
Infektionshygiejnisk Enhed, 2007
19
Årsberetning 2007
http://www.rigshospitalet.dk/NR/rdonlyres/D9F7172B-190D-4DA0-81B3-
E347DE24F197/0/IHE%C3%A5rsberetning2007.pdf
Kaufhold, A. & Potgieter, E., 1993
Chromosomally mediated high-level gentamicin resistance in Streptococcus mitis
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 37(12), s. 2740-2742
Lynettefællesskabet I/S, 2004
Måleprogram- Antibiotikaresistens I spildevand fra et sygehus og et boligområde
Samarbejdsprojekt mellem Lynettefællesskabets Miljøgruppe og Statens Serum Institut.
Rapport udarbejdet af DHI.
Lynettefællesskabet I/S, 2007
Kortlægning og vurdering af spildevand med antibiotika og resistente bakterier fra
hospitaler
Rapport udarbejdet af DHI.
Marcinek, H., Wirth, R., Muscholl-Silberhorn, A. & Gauer, M.,1998
Enterococcus faecalis gene transfer under natural conditions in municipal sewage wa-
ter treatment plants
Applied Environmental Microbiology, 64(2), s. 626-632
Miljøstyrelsen, 2002
Occurrence and fate of antibiotic resistant bacteria in sewage
Miljøprojekt Nr. 722
OUH, 2009
Årsrapport 2009
Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Odense Universitetshospital
Statens Serum Institut, 2010
Fakta om antibiotikaforbrug: Antibiotikaforbrug i Danmark
http://www.ssi.dk/Smitteberedskab/Om%20overvaagning/Antibiotikaforbrug/Fakta%20
om%20antibiotikaforbrug.aspx
Schreiber, C., 2011
Einträge, Vorkommen, Verbreitung und gesundheitliche Bedeutung
antibiotikaresistenter Bakterien in Abwasser und Gewässern
Ph.D., Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn
Schumacher, H., Skibsted, U., Skov, R. & Scheibel, J., 1996
Cefuroxime Resistance in Escherichia coli. Resistance Mechanisms and Prevalence.
APMIS- Acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica, 104, s. 531-
538
Suh Yah, C., 2010
Plasmid-Encoded Multidrug Resistance: A case study of Salmonella and Shigella from
neteric diarrhea sources among humans
Biological Research, 43, s. 141-148
20
21
B I L A G
22
23
BILAG A
Protokol for bestemmelse af resistens mod ciprofloxacin, gentamicin og ce-
furoxim hos Escherichia coli og coliforme
Definition
Suspekte E. coli defineres som violette kolonier på Oxoid Brilliance E. coli/coliform selective
agar (CM1046). Coliforme defineres som lyserøde kolonioer på Oxoid Brilliance E.
coli/coliform selective agar (CM1046) efter inkubation i 24 timer ved 44 °C.
Prøvetagning og transport
Prøverne er udtaget, og transport er arrangeret af DHI - UAI.
Reagenser
Trypton-saltvand:
Trypton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g
Oxoid Brilliance E. coli/coliform selective agar (CM1046) (28.1 g/l) med og uden antibiotika.
Natrium-cefuroxim, Sigma-Aldrich C4417-1G. Der opløses 80 mg i 10 ml MQ vand og tilsat
1,00 ml/l agar.
Gentamicin opløsning, Sigma-Aldrich G1397-10ML (50 mg/l). Der tilsættes 80 µl/l agar.
Ciprofloxacin. Sigma-Aldrich 17850-5G-F. Der afvejes 100 mg/100 ml sterilt MQ-vand med 1
ml 1M HCl og tilsættes 1 ml/l agar.
Udførelse
Der laves 10-fold fortyndingsrække.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Brilliance uden antibiotika.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Brilliance tilsat ciprofloxacin
(1 mg/l), gentamicin (4 mg/l) eller cefuroxim (8 mg/l).
Plader inkuberes ved 44 °C i 22-26 timer.
Aflæsning
Alle violette kolonier tælles som suspekte E. coli.
Alle pink kolonier tælles som coliforme.
Alle tydeligt blå eller farveløse kolonier anses for at være andre end E. coli eller coliforme.
Kolonier, der er pink, men med svag blå nuance, tælles som coliforme.
Det ene sæt plader sendes til IHE efter tælling.
Kontroller
E. coli ATCC 25922 er følsom over for ciprofloxacin (MIC < 0,015 mg/l), gentamicin (MIC =
0,1 – 1 µg/ml) og cefuroxim (MIC = 2 – 8 µg/ml) og anvendes som positiv kontrol. Spredes også
på agar uden antibiotika for substratkontrol.
24
25
BILAG B
Protokol for bestemmelse af resistens mod vancomycin hos suspekte
enterokokker
Definition
Suspekte enterokokker defineres som bakterier der ved 44 °C ± 0,5 °C kan vokse på Slanetz &
Bartley Agar (Oxoid) under reduktion af TTC.
Prøvetagning og transport
Prøverne er udtaget, og transport er arrangeret af DHI - UAI.
Reagenser
Pepton-saltvand (ISO8199:1988)
Pepton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g
Vancomycin, Sigma-Aldrich 861987-250mg. Der er opløst 40 mg/10 ml MQ-vand og tilsat 1
ml/l agar.
Slanetz & Bartley (Oxoid) agar.
Udførelse
Der laves 10-fold fortyndingsrække.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Slanezt agar uden antibiotika.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Slanezt agar med vancomycin
(4 µg/ml).
Plader inkuberes ved 44°C ± 0,5°C i 44 ± 4 timer.
Alle kolonier, der vokser frem som røde kolonier, tælles. Der laves ikke verifikation.
Andelen af suspekte enterokokker, der vokser på agar med antibiotika, beregnes.
Kontroller
Enterococcus faecalis ATCC 29212 anvendes som positiv kontrol (MIC 2 – 6 mg/l). Spredes
også på agar uden antibiotika for substratkontrol.
26
27
BILAG C
Protokol for bestemmelse af resistens mod ciprofloxacin, gentamicin og
cefuroxim hos suspekte Klebsiella
Definition
Suspekte Klebsiella sp. defineres her som kolonier, der giver ”purple-magenta” farvede kolonier
på HiCrome™ Klebsiella Selective Agar efter inkubation i 24 timer ved 37 °C.
Prøvetagning og transport
Prøverudtagning og transport arrangeres af DHI - UAI.
Reagenser:
Pepton-saltvand (ISO8199:1988)
Pepton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g
Natrium-cefuroxim, Sigma-Aldrich C4417-1G. Der er opløst 80 mg i 10 ml MQ vand og tilsat
1,00 ml/l agar.
Gentamicin opløsning, Sigma-Aldrich G1397-10ML (50 mg/l). Der tilsættes 80 µl/l agar.
Ciprofloxacin. Sigma-Aldrich 17850-5G-F. Der afvejes 100 mg/100 ml sterilt MQ-vand med 1
ml 1M HCl og tilsættes 1 ml/l agar.
Udførelse
Der lave 10-fold fortyndingsrække.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i dublikat på HiCrome™ Klebsiella
Selective Agar uden antibiotika.
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i dublikat på HiCrome™ Klebsiella
Selective Agar tilsat ciprofloxacin (1 mg/l), gentamicin (4 mg/l) eller cefuroxim (8 mg/l).
Plader inkuberes ved 37 °C i 22-26 timer.
Alle ”purple-magneta” kolonier tælles som suspekte Klebsiella sp.
Hvis der er stor usikkerhed om vurdering af positive kolonier, føres et passende udvalg (cirka 5
fra hver prøve uden antibiotikum og 5 fra hver prøve med gentamicin) videre på HiCrome™
Klebsiella Selective Agar for yderligere verifikation. Klebsiella sp er store fede kolonier.
Kontroller
Der anvendes ikke kontroller, idet det antages, at antibiotika aktiviteten kontrolleres i forbindelse
med undersøgelse af E. coli. Årsagen er, at vi ikke har en kontrolstamme med kendt følsomhed.
28
Analyser, muslingeprøver
DHI: Muslingekød blendes 10 % (gwt/vol) og spredes som angivet for spildevandsprøver.
Desuden dyrkes op i MacConkey bouillon med og uden antibiotika (ciprofloxacin 1 mg/l,
gentamicin 4 mg/l, eller cefuroxim 8 mg/l). Rør sendes til IHE.
29
BILAG D
IHEs resultater for enterokokker dyrket på Slanetz agar.
30
31
BILAG E
32
33
BILAG F
IHEs resultater for E.coli, Klebsiella og enterokokker i sedimentprøverne fra Kongedybet.