BAKTRIJU DAUDZVEIDBA V daaVizma NikolajevaLU Bioloijas fakultte

ARHEJUJEB ARHEBAKTRIJU VALSTSJEB DOMNSARCHAEATipi: 1. Crenarchaeota2. Euryarchaeota3. Korarchaeota ?4. Nanoarchaeota ?

Arhebaktrijas

Woese C., Wolfe R. Classification of methanogenic bacteria by 16S ribosomal RNA characterization. PNAS USA, 1977, v. 74, 4537-4541.

Woese C., Fox G. Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms. PNAS USA, 1977, v. 74, 5088-5090.

ArhejiArhebaktriju lipdi un membrnu struktras

ArhejiArhebaktriju pseidopeptdgliknastruktra (Methanobacterium sp.)Eibaktriju peptdgliknastruktra (Escherichia coli)

Arhejinapvalka parakristlisk struktra. S-slnis ar heksagonlu simetriju

1. Crenarchaeota tipsKlase: ThermoproteiRinda: ThermoprotealesDzimta: ThermoproteaceaeThermofilaceaeRinda: DesulfurococcalesDzimta: DesulfurococcaceaePyrodictiaceaeRinda: SulfolobalesDzimta: SulfolobaceaeVisas krsojas gramnegatviObligti termofilas, aug no 60 ldz >100 C. Acidofilas. Lielk daa metaboliz sru

Klase ThermoproteiDzimta Thermoproteaceaeintis: ThermoproteusCaldivirgaPyrobaculumThermocladiumNjias un pavedieni, 0,4-0,5 x 1,5-20 m. Aerobos apstkos nu gali parasti paplainti (golfa njias). Mreni acidofilas. Hipertermofilas. Opt. 75-100 C, pH 3,7-7. Anaerobas vai nosacti anaerobas. Aug hemolitoautotrofi, iegstot eneriju sra reducan un izmantojot CO2 par viengo C avotu, vai organotrofi, izmantojot sra elpoanu un nordot organisks vielas. Izplattas sru saturoos karstajos avotos un zemdens eotermlajs sistms

Thermoproteus njias un neseptti pavedieni. AnaerobasKlase ThermoproteiDzimta ThermoproteaceaeT. tenax1 m1 m

Klase ThermoproteiDzimta Thermofilaceaeints: ThermofilumObligti anaerobas. Opt. 85-90 C. Biei abi nas gali paplainti. Izmanto peptdusT. pendens1 m

Dzimta DesulfurococcaceaeKlase Thermoproteiintis: DesulfurococcusAeropyrumIgnicoccusStaphylothermusStetteriaSulfophobococcusThermodiscusThermosphaeraKokveida vai diskveida nas, 0,2-5 m diametr. Opt. 85-95 C. Anaerobas, izemot vienu aerobu sugu

Klase ThermoproteiDzimta DesulfurococcaceaeDesulfurococcus koki. Izmanto oghidrtus vai olbaltumvielasAeropyrum pernix (vieng suga int) oti kustgi neregulri koki. Aerobas. Heterotrofas. Aug 70-100 C, pH 5-9, NaCl 1,8-7,0 %. Izmanto olbaltumvielasStaphylothermus marinus (vieng suga int) koki. Zem substrta koncentrcij nas skas (0,5-1 m diametr) un veido lielus agregtus, ldz 100 nm; liel koncentrcij lielas (ldz 15 m diametr) un vairk pa vienai vai pros. AnaerobasStaphylothermus marinus

Klase ThermoproteiDzimta Pyrodictiaceaeintis: PyrodictiumHyperthermusPyrobolusKoki vai diskveida nas. Aug hemolitoautotrofi, iegstot eneriju sra reducan un izmantojot CO2 par viengo C avotu, vai organotrofi, fermentjot organisks vielas. Izplattas sru saturoos karstajos avotos un zemdens eotermlajs sistms

Klase ThermoproteiDzimta PyrodictiaceaePyrodictium diskveida vai vjveida nas. napvalks sastv no glikoprotena. Obligti anaerobas. Aug 80-110 C, pH 5-7Pyrodictium abyssi nas ieslgtas glikoprotena matric

Klase ThermoproteiDzimta Sulfolobaceaeintis: SulfolobusAcidianusMetallosphaeraStygiolobusSulfurisphaeraSulfurococcusKokveida nas. Ekstrmi termoacidofilas: opt. pH ap 2, 60-90 C. Nosacti vai obligti hemolitoautotrofi S0 metaboliztji

Klase ThermoproteiDzimta SulfolobaceaeSulfolobus aerobas, nosacti hemolitoautotrofas. Organotrofi izmanto dadas organisks vielas. Aug pH 1-5,5. napvalks sastv no glikoprotena subvienbm ar trijstrveida simetrijuAcidianus parasti diskveida vai vjveida nas. Nosacti anaerobas. Autotrofas vai miksotrofasAcidianus infernusSulfolobus acidocaldarius

2. Euryarchaeota tipsKlases: 1. Methanobacteria2. Methanococci3. Halobacteria4. Thermoplasmata5. Thermococci6. Archaeglobi7. MethanopyriKrsojas gampozitvi vai gramnegatvi atkarb no t, vai napvalks satur vai nesatur pseidomurenu. Dadas fizioloisks grupas

Klase MethanobacteriaRinda: MethanobacterialesDzimta: Methanobacteriaceaeintis: MethanobacteriumMethanobrevibacterMethanosphaeraMethanothermobacterDzimta: Methanothermaceaeints: MethanothermusMetanogni. Reduc CO2 vai metilsavienojumus. Elektronu donori H2, formits vai otrjie spirti. Satur pseidomurenu

Klase MethanobacteriaDzimta MethanobacteriaceaeMethanobacterium obligti anaerobas. Satur pseidomurenu. Opt. 37-45 C. Atrodas anaerobos nordtjos, salddens ds, atgremotju kuMethanobrevibacter obligti anaerobas. Satur pseidomurenu. Aug 30-45 C. Nepiecieami vitamniMethanobrevibacterruminantiumMethanobacteriumsp.Methanothermobacter opt. 55-65 C

Klase MethanobacteriaDzimta Methanothermaceaeints: MethanothermusNjias, pa vienai vai ss dtsnapvalks sastv no diviem sliem pseidomurena un olbaltumvielu subvienbu veidota S-sla. Krsojas grampozitvi Polras viciasObligti anaerobasHemolitotrofas, no H2 un CO2 veido metnu. S0 reduc par H2SAug 60-97 CBrvi dzvo anaerob sru saturo vid

Klase MethanococciRinda: MethanococcalesDzimtas: MethanococcaceaeMethanocaldococcaceaeRinda: MethanomicrobialesDzimtas: MethanomicrobiaceaeMethanocorpusculaceaeMethanospirillaceaeGenera incertae sedisRinda: MethanosarcinalesDzimtas: MethanosarcinaceaeMethanosaetaceaeMetanognas. Anaerobas. Reduc CO2, formitu vai metilsavienojumus. Nesatur pseidomurenu

Klase MethanococciDzimta Methanococcaceaeintis: MethanococcusMethanothermococcusMethanococcus kustgi, neregulri koki, napvalks no olbaltumvielm. Mezofilas. Opt. 35-40 C, pH6-8. Nepiecieams NaCl. Obligti metanognas. Dzvo jrs

Methanothermococcus thermolithotrophicus (vieng suga int) termofilas, aug 17-70 C, opt. 60-65 C. Nepiecieams NaCl

Methanocaldococcus jannaschii, opt. 85 CDzimta Methanocaldococcaceaeintis: MethanocaldococcusMethanotorrisMethanocaldococcus kustgi, neregulri koki, napvalks no olbaltumvielm. Hipertermofilas. Opt. 80-85 C. Nepiecieams NaCl. Selns var stimult auganu. Izdalti no zemdens hidrotermlajm sistmmKlase Methanococci

Dzimta Methanomicrobiaceaeintis: MethanomicrobiumMethanoculleusMethanofollisMethanogeniumMethanolaciniaMethanoplanusNesatur pseidomurenu. Obligti anaerobas. Dzvo anoksign dens vid un dzvnieku gremoanas traktKlase Methanococci

Dzimta MethanomicrobiaceaeMethanomicrobium mobile (vieng suga int) njias, napvalks sastv no heksagonlu glikoprotena subvienbu S-sla. Aug 25-45 C, pH 5,9-7,7. Nepiecieams acetts. Izdaltas no atgremotju kua

Methanogenium neregulri koki. Nepiecieams NaCl un organiski auganas faktori. Atrodas ds

Methanoplanus strainas vai diskveida nas, 1-3,5 m garas, 1-2 m platas un 0,07-0,3 m biezas. Mezofilas, opt. 32-40 C neitrl vid. Izdaa no purviem un naftas akm. Daas sugas ir jras skropstaiu endosimbiontiKlase Methanococci

Dzimta Methanocorpusculaceaeints: MethanocorpusculumSki, neregulri kokiOpt. 30-40 C, neitrls pH, 0,1-0,25 m NaClNepiecieams acetts vai citi auganas faktoriAtrod anaerobos nordtjos un ezeru anoksigns dsKlase Methanococci

Dzimta Methanospirillaceaeints: MethanospirillumViena suga M. hungateii. Kustgas, garas, simetriski liektas njias, veido viainus pavedienus, ko apem maksts. Opt. 30-37 C. Saista N2. Miksotrofas. Izdala no notekdeu du nordtjiemKlase Methanococci

Dzimta MethanosarcinaceaeKlase Methanococciintis: MethanosarcinaMethanococcoidesMethanohalobiumMethanohalophilusMethanolobusMethanosalsumKokveida nas vai pseidosarcnas. Nesatur pseidomurenu. Miksotrofas. Atrodas dados anaerobos biotopos

Klase MethanococciDzimta MethanosarcinaceaeMethanosarcina nekustgas, neregulras sfriskas nas (1-3 m diametr), pa vienai vai agregtos ldz 1000 m diametr, kur daudzas nas aptver kopgs apvalks. Reizm veidojas lielas cistas. Mezofilas un termofilas sugas. Daas sugas acidofilas vai acidotolerantas. Halotolerantas. Dzvo denM. barkeri10 m200 nm

Klase MethanococciDzimta MethanosarcinaceaeMethanosalsum zhilinae (vieng suga int) kustgi, neregulri, straini koki, pa vienam, tetrds vai kaudzs. napvalks ir S-slnis. Aug 20-50 C, 0,2-2,1 M NaCl, pH 8-10. Dzvo srmain un s vid (sodas ezeru diben)1 m1 m

Klase MethanococciDzimta Methanosaetaceaeints: MethanosaetaNekustgas, taisnas njias, parasti maksts. Vairojas rpus makstm. Maksts starp nm atrodas rssienas. Izmanto viengi acettu un CO2. Mezofilas un termofilas sugas. Aug pH 5,5-8,4. Atrodas ds un anaerobos du nordtjosM. thermophila ar gzes vakuolmM. consilii1 mrssienas

Klase Halobacteria - halobaktrijasRinda: HalobacterialesDzimta: HalobacteriaceaeAerobas un nosacti anaerobasNepiecieams vismaz 1,5 M NaClKolonijas parasti roz vai sarkanas (satur C50 karotinodus jeb bakteriorubernus)Parasti citoplazmatisk membrna satur bakteriorodopsnu (darbojas k gaismas sensori un protonu pumpji). To sauc par purpurmembrnuOpt. 35-50 CHemoorganotrofas, izmanto aminoskbes un oghidrtusParasti satur lielas plazmdas (>100 kb)Izplattas visur, kur liela sls koncentrcija

intis: Halobacterium, Haloarcula,Halobaculum,Halococcus,Haloferax,Halogeometricum,Halorhabdus, Halorubrum,Haloterrigena,Natrialba,Natrinema,Natronobacterium,Natronococcus,Natronomonas,NatronorubrumKlase HalobacteriaDzimta Halobacteriaceae

Klase HalobacteriaDzimta HalobacteriaceaeHalobacterium salinarum (vieng suga int) kustgas, taisnas vai pleomorfas njias. napvalks sastv no glikoprotenu subvienbm. Ekstremli halofilas. Aug 3,0-5,2 M NaCl, 15-55 C, pH 5,5-8,5. Lielk daa sugu proteoltiskas

Haloarcula pleomorfas vai plakanas, taisnstrveida nas. Ekstremli halofilas. Izmanto oghidrtusHaloarcula sp.

Klase HalobacteriaDzimta HalobacteriaceaeHaloferax ekstremli pleomorfas, plakanas nas. napvalks satur glikoprotenu. Obligti aerobas. Aug 1,5-4,5 M NaCl, 30-55 C, pH 5-8. Uzkrj PHAHaloferax volcanii1 m

Klase HalobacteriaDzimta HalobacteriaceaeNatronobacterium gregoryi (vieng suga int) nekustgas dada garuma njias. Aerobas. Oghidrti stimul auganu. Alkalifilas, opt. pH 9,5-10,0. Aug 2,0-5,2 M NaCl, 25-40 C

Natronococcus nekustgi koki. Aerobas Oghidrti stimul auganu. Alkalifilas, opt. pH 9,5-10,0. Aug 1,4-5,2 M NaCl, 22-50 C

Klase ThermoplasmataRinda: ThermoplasmatalesDzimta: Thermoplasmataceaeints: ThermoplasmaDzimta: Picrophilaceaeints: PicrophilusKlas ietilpst ekstremli acidofili termofili arheji, tai skait arheji bez napvalka (Thermoplasma).

Klase ThermoplasmataDzimta ThermoplasmataceaeThermoplasma kustgas, pleomorfas nas bez napvalka. Krsojas gramnegatvi. Nosacti anaerobas. Obligti termoacidofilas. Opt. 55-59 C, pH 1-2. Neitrl vid lizjas. Obligti heterotrofas. Atrod pasakarsus ogls un skb, sru saturo eoterml vidT. volcanium nas ar vicim

Klase ThermoplasmataDzimta PicrophilaceaePicrophilus neregulri, nekustgi kokiTermofilas, hiperacidofilas, obligti aerobasTetragonls S-slnisHeterotrofas, izmanto oghidrtus rauga ekstrakta kltbtnAug 47-60 C, pH 0-3,5Atrodas eotermls sru saturos augsns un avotos

Klase ThermococciRinda: ThermococcalesDzimta: Thermococcaceaeintis: ThermococcusPyrococcusNeregulri, pleomorfi koki. Satur S-slni. Hipertermofilas. Obligti anaerobas. Heterotrofas. Izmanto peptdus un/ vai oghidrtus. Lielkajai daai nepiecieams srs, rodas H2S. Opt. 75-100 C. Izplattas virszemes un zemdens karstajos avotos

Klase ThermococciDzimta ThermococcaceaeThermococcus koki pa vienam vai pros. Opt. 75-88 C, pH 6-8, 2-4 % NaCl. Srs stimul auganu, vid bez sra izdals H2. Dals saspieotiesT. barophilus atmosfras spiedien aug 48-95 C, opt. 85 C; liels hidrostatiskais spiediens stimul auganu 75-95 C. Obligti barofilas 95-100 C (15,0-17,5 MPa). Izdaltas no Atlantijas okena dibena 3550 m dzium, 40 MPa, 95 CT. celer1 m

Klase ThermococciPyrococcus kustgi, nedaudz neregulri koki, pa vienam vai pros. Aug pH 5-9, 0,5-5 % NaCl, 67-103 C, opt. ap 100 C. enercijas laiks ss 35 min. opt. apstkos. napvalks sastv no glikoprotenaDzimta ThermococcaceaeP. furiosus1 m

Klase ArchaeoglobiRinda: ArchaeoglobalesDzimta: Archaeoglobaceaeintis: ArchaeoglobusFerroglobusDadas formas koki, pa vienam vai pros. Hipertermofilas, opt. ap 80 C. Obligti anaerobas. Neitrofilas. napvalka S-slnis sastv no olbaltumvielu subvienbm. Zilzaa fluorescence 420 nm. Elektronu akceptori sulfts, sulfts, tiosulfts (reduc ldz sulfdam) un/ vai nitrts. S0 inhib auganu. Izdala no eotermlajiem paraugiem

Dzimta ArchaeoglobaceaeKlase ArchaeoglobiArchaeoglobus kustgi koki. Gludas, zili melnas kolonijas 1-2 mm diametr. Hemoautotrofi, augot ar H2/ CO2. Hemoorganotrofi, izmantojot formitu, formamdu, lakttu, glikozi, cieti, kazaminoskbes, peptonu, elatnu, kazenu, gaas ekstraktu, rauga ekstraktu, baktriju un arheju nu ekstraktu

Ferroglobus placidus (vieng suga int) kustgas kokveida nas. Nosacti hemolitoautotrofas. Oksid Fe2+, S2- un H2; elektronu akceptors nitrts, H2 kltbtn ar S2O32-

Klase MethanopyriRinda: MethanopyralesDzimta: Methanopyraceaeints: MethanopyrusNjias. Grampozitva napvalka struktra, satur pseidomurenu. Hipertermofilas, aug 100 C, bet neaug zem 80 C. Obligti anaerobas. Aug hemolitoautotrofi, izmantojot H2/ CO2 un veidojot metnu

Dzimta MethanopyraceaeKlase MethanopyriMethanopyrus kandleri (vieng suga int) kustgas njias, 0,5 x 2-14 m. Aug 0,2-4 % NaCl, pH 5,5-7. Iezaganas kolonijas. Fluoresc 420 nm. H2S izraisa nu lizanos. Izdaltas no melno skursteu rajoniem u.c.M. kandleri