Etude de la résistance aux antibiotiques des bactéries ?· La résistance des bactéries aux antibiotiques…

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    14-Sep-2018

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<ul><li><p>1 </p><p> Rpublique Algrienne Dmocratique et Populaire </p><p> Ministre de lEnseignement Suprieur et de la Recherche Scientifique </p><p> Universit Abou Bekr Belkaid-Tlemcen </p><p> Facult des Sciences de la Nature et de la Vie </p><p> et Sciences de la Terre et de lUnivers </p><p> Dpartement de Biologie </p><p> Laboratoire de Microbiologie Applique lAgroalimentaire au </p><p> Biomdical et lEnvironnement </p><p> MEMOIRE DE MAGISTER </p><p> Option : Maitrise de la qualit microbiologique et du dveloppement microbien </p><p> THEME </p><p> Prsent par </p><p> Melle Liazid Asma </p><p>Devant le jury compos de </p><p>Mr MOUSSA BOUDJEMAA B., Professeur lUniversit de Tlemcen Prsident </p><p>Mme HASSAINE H., Maitre de Confrence de Classe A lUniversit de Tlemcen Examinateur </p><p>Mr ABDELOUAHID D.E., Professeur lUniversit de Tlemcen Examinateur </p><p>Mr Drissi M ., Maitre de Confrence lUniversit de Tlemcen Promoteur </p><p> Anne universitaire : 2011-2012 </p><p>Etude de la rsistance aux antibiotiques des bactries </p><p> Gram ngatif non fermentantes au niveau du </p><p>C.H.U de Tlemcen </p></li><li><p>2 </p><p> Je ddie cet humble travail </p><p> A </p><p> ALLAH le tout puissant qui je dois tout. </p><p> Mes trs chers parents </p><p> Pour leur amoure, leurs encouragements et soutien sans faille </p><p> Je les remercie de mavoir accompagne tout au long de mon parcours </p><p>Mes frres et surs, Que ce travail les incite mieux faire et quil soit un faible </p><p> tmoignage de laffection de leur grande sur </p><p> Mes oncles, pour leur aide et encouragement sans cesse </p><p> Tous mes camarades de promotion : Khadija, Asma, Karima, Rachida, Mohammed, </p><p> Amine et Omar </p><p>Mes collgues du laboratoire : Imene, Esma, Djahida, Tma et Amel, pour les moments </p><p> inoubliables passs ensemble et pour leur soutien. </p></li><li><p>3 </p><p> REMERCIEMENTS </p><p> Ce travail a t ralis au niveau du laboratoire Antibiotiques, </p><p>Antifongiques de lUniversit Abou Bekr Belkaid. </p><p> Je tiens remercier, Monsieur le Promoteur, DRISSI M., maitre de confrences </p><p> lUniversit de Tlemcen, pour avoir accept dencadrer mon travail, pour sa rigueur </p><p>scientifique, pour son assistance bien matrielle que morale, pour son aide et son </p><p>soutien. </p><p> Mes remerciements sadressent galement </p><p>Mr MOUSSA BOUDJEMAA B., Professeur lUniversit de Tlemcen qui a honor ce </p><p>travail en acceptant de prsider le jury ., je len remercie profondment. </p><p>Mme HASSAINE H., Maitre de Confrences de Classe A lUniversit de Tlemcen, je </p><p>la remercie davoir accept dexaminer ce travail. </p><p>Mr ABDELOUAHID D.E., Professeur lUniversit de Tlemcen ma fait lhonneur de </p><p>participer ce jury et dexaminer ce travail. </p><p>Mme BOUCHERIT Z., de mavoir accueillir au niveau de son laboratoire. </p><p> Je tiens remercie aussi </p><p>Mr BELLAHCEN M., Professeur lUniversit de Mostaganem pour son aide et ses </p><p>conseils. </p><p>Tous les personnels des services de ranimation, ORL, neurochirurgie et chirurgie. </p><p>Ces remerciements ne seraient pas complets sans associer toutes les personnes ayant </p><p>contribu, de prs ou de loin, la ralisation de ce travail. </p></li><li><p>4 </p><p> Sommaire </p><p>LISTE DES FIGURES ......................................................................................................... </p><p>LISTE DES TABLEAUX ..................................................................................................... </p><p>LISTE DES ANNEXES ........................................................................................................ </p><p>INTRODUCTION ................................................................................................................. 1 </p><p> Partie I : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE </p><p>Chapitre I. Les antibiotiques................................................................................................ 2 </p><p>1. Les -lactamines .................................................................................................................. 2 </p><p>1.1. Dfinition .......................................................................................................................... 2 </p><p>1.2. Classification des -lactamines ........................................................................................ 2 </p><p>1.2.1. Pnames ......................................................................................................................... 2 </p><p>1.2.2. Cphmes ...................................................................................................................... 2 </p><p>1.2.3. Carbapnmes ............................................................................................................... 4 </p><p>1.2.4. Monobactames .............................................................................................................. 4 </p><p>1.2.5. Inhibiteurs des -lactamases ......................................................................................... 4 </p><p>1.3. Mcanisme daction des -lactamines ............................................................................. 5 </p><p>1.3.1 Pntration des -lactamines dans les bactries ............................................................ 5 </p><p>1.3.2 Cible des -lactamine : protines liant les pnicillines (PLP) ............................................................... 6 </p><p>2. Les aminosides .................................................................................................................... 6 </p><p>2.1. Dfinition .......................................................................................................................... 6 </p></li><li><p>5 </p><p>2.2. Classification des aminosides .......................................................................................... 6 </p><p>2.3. Mcanisme daction des aminosides................................................................................ 6 </p><p>3. Quinolones ........................................................................................................................... 7 </p><p>3.1. Dfinition .......................................................................................................................... 7 </p><p>3.2. Classification des quinolones ........................................................................................... 7 </p><p>3.3. Mcanisme daction des quinolones ................................................................................ 8 </p><p>4. -lactamases ........................................................................................................................ 8 </p><p>4.1. Classification des -lactamases ....................................................................................... 9 </p><p>Chapitre II. Les bacilles Gram ngatif non fermentaires.............................................. 11 </p><p>1. Pseudomonas aeruginosa ................................................................................................... 11 </p><p>1.1. Mcanismes de rsistance aux -lactamines chez Pseudomonas aeruginosa ................ 12 </p><p>1.1.1. Rsistance naturelle ....................................................................................................... 12 </p><p>1.1.2. Rsistance acquise ......................................................................................................... 13 </p><p>1.1.2.1. Rsistance enzymatique ............................................................................................. 13 </p><p>1.1.2.2. Rsistance non enzymatique ...................................................................................... 15 </p><p>1.2. Rsistance aux fluoroquinolones ..................................................................................... 16 </p><p>1.3. Rsistance aux aminosides ............................................................................................... 17 </p><p>2. Acinetonacter baumannii .................................................................................................... 17 </p><p>2.1. Mcanisme de rsistance aux -lactamines chez Acinetobacter baumannii .................. 18 </p><p>2.1.1. Rsistance naturelle ....................................................................................................... 18 </p><p>2.1.2. Rsistance acquise ......................................................................................................... 18 </p><p>2.1.2.1 Rsistance enzymatique .............................................................................................. 18 </p></li><li><p>6 </p><p>2.1.2.2. Rsistance non enzymatique ...................................................................................... 19 </p><p>2.2. Rsistance aux aminosides ............................................................................................... 20 </p><p>3. Stenotrophomonas maltophilia ........................................................................................... 20 </p><p>3.1. Rsistance aux -lactamines ............................................................................................ 21 </p><p>3.2. Rsistance aux aminosides ............................................................................................... 22 </p><p>3.3. Rsistance aux fluoroquinolones ..................................................................................... 22 </p><p>4. Burkholderia cepacia .......................................................................................................... 22 </p><p>4.1 Rsistance aux antibiotiques ............................................................................................. 23 </p><p>5. Ochrobacterum anthropi ..................................................................................................... 23 </p><p>5.1. Rsistance aux antibiotiques ............................................................................................ 24 </p><p> Partie II : MATERIEL ET METHODES </p><p>1. Matriel ................................................................................................................................ 25 </p><p>1.1. Matriel biologiques ......................................................................................................... 25 </p><p>1.1.1. Souches tudies ........................................................................................................... 25 </p><p>1.1.2. Souches de rfrences et plasmides utiliss ................................................................. 25 </p><p>1.2. Milieux de culture ............................................................................................................ 25 </p><p>1.3. Tests biochimiques ........................................................................................................... 25 </p><p>1.4. Antibiotiques .................................................................................................................... 26 </p><p>1.4.1. En disque ....................................................................................................................... 26 </p><p>1.4.2. En poudre ...................................................................................................................... 26 </p><p>2. Mthode ............................................................................................................................... 26 </p></li><li><p>7 </p><p>2.1. Prlvements .................................................................................................................... 26 </p><p>2.2. Isolement et purification ................................................................................................. 26 </p><p>2.3. Identification .................................................................................................................... 26 </p><p>2.4. Test doxydase .................................................................................................................. 27 </p><p> 2.5. Antibiogramme................................................................................................................ 27 </p><p> 2.6. Dtermination des CMI en milieu solide ........................................................................ 29 </p><p>2.7. Test la cloxacilline ......................................................................................................... 30 </p><p>2.8. Test de synergie ................................................................................................................ 30 </p><p>2. 9. Test de Hodge .................................................................................................................. 31 </p><p>2. 10. Test IMP-EDTA ........................................................................................................... 31 </p><p> 2.11. Extraction de lADN plasmidique ................................................................................ 32 </p><p> 2. 12. Electrophorse sur gel dagarose ................................................................................. 33 </p><p> Partie III : RESULTATS ET DISCUSSION </p><p>1. Rsultats .............................................................................................................................. 35 </p><p>1.1. Prlvements .................................................................................................................... 35 </p><p>1.2. Souches tudies .............................................................................................................. 35 </p><p>1.3. Etude de la rsistance aux antibiotiques dAcinetobacter baumannii ........................... 38 </p><p>1.4. Dtermination des niveaux de CMI ................................................................................. 39 </p><p>1.5. Test la cloxacilline ......................................................................................................... 40 </p><p>1.6. Test de synergie ................................................................................................................ 41 </p><p>1.7. Recherche denzymes ayant une activit cabapnmases .............................................. 41 </p><p>1.8. Plasmides : visualisation sur gel dagarose ..................................................................... 43 </p></li><li><p>8 </p><p>1. 9. Rsistance aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa ........................................... 44 </p><p>1. 10. Phnotype de rsistance aux -lactamines de Pseudomonas aeruginosa .................... 44 </p><p>2. Discussion.................</p></li></ul>

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