20
Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France Sophie Granier

Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

  • Upload
    others

  • View
    3

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Sophie Granier

Page 2: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

2

Directive 2003/99/ECArt. 7(3) and 9(1) + Annexes II (B) IV

EU Implementing Legislation:

Decision 2013/652/EU2014 - 2020

Monitoring AMR: Legal and Technical Bases

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of AMR in

Salmonella, Campylobacter,indicator commensal E. coli and

Enterococcus spp. transmitted throughfood

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of MRSA in

food-producing animals and food

EFSA Tech. Spec. on randomisedsampling for harmonised monitoringof AMR in zoonotic and commensal

bacteria

2012

2014

EFSAScientific Opinions

on AMR

. EQAAs (AST)

. Protocols

Harmonisation. Susceptibility Testing (microdilution). Set of substances tested and dilution ranges. Interpretative criteria of resistance (ECOFFs). Representative sampling designs

2011-2016Action Plan against

the rising threats of AMR

© PA Beloeil 2018

Page 3: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Le poul

etLa dinde

La pondeuse

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 4: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

optionnel

Obligatoire

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 5: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Fréquence, taille et plan d’échantillonnage 170 isolats par couple esp bact/esp animale 300 prélèvements pour la surveillance spécifique des E. coli

productrices de BLSE/pAmpC/carbapénèmase Répartition tout au long de l’année proportionnel aux volumes d'abattage 1 isolat / unité épidémiologique

Méthodologie CMI en milieu liquide microplaques harmonisées Epidemiological cut-off EUCAST

Report des données données individuelles Transformation et transfert des données à l’EFSA

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 6: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca

Multirésistance (R) chez le porc (N=214) et chez le veau (N=201)

31%

24 %

10 %

11 %

16 %

8 %

0,5 %

S1 R2 R3 R4 R5 R8 R

31%

8%

11%15%

18%

8%

5% 3% 1%S1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R

AMP-TET-SMX-TMP TET

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 7: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017

% re

sist

ance

AmpicillineSulfaméthoxazoleTétracyclineTriméthoprimeChloramphénicol

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca

Evolution dans le temps (% de résistance élevés)

Diminution significative sur les 9 années d’observation, testé par une régression linéaire simple (p<0,05)

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 8: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca

Evolution dans le temps (% de résistance faibles à rares)

0

2

4

6

8

10

2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017

% re

sist

ance

Céfotaxime

Ceftazidime

Colistine

Gentamicine

Méropénème

Ciprofloxacine

Acide Nalidixique

Augmentation significative sur les 9 années d’observation, testé par une régression linéaire simple (p<0,05)

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 9: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca

Evolution dans le temps (2015-2017)

0,0

20,0

40,0

60,0

80,0

100,0

% ré

sist

ance

2015

2017

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 10: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

E. coli résistants aux céphalosporines de 3ème génération

Caeca Viande

Flore dominante Flore sous-dominante (Recherche Sélective)

0,5% (N souches =214) 28,1% (N prélèvements =327) 0,9% (N prélèvements =324)

0,5% (N souches =201) 39,8% (N prélèvements =299) 0,3% (N prélèvements =324)

‒ Résistance enzymatique majoritaire = BLSE

‒ Co-Résistances associées : TET/SMX pour le porc et TET/SMX/TMP/CHL pour le veau

‒ pas de souche productrice de carbapénèmase

201535,8% 50,7%

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 11: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Nombre de prélèvements sur carcasses Nombre de salmonelles isolées Prévalence

1606 206 7,8 %2850 16 0,01 %

Salmonella spp.

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Sérovars majoritaires :

S. variant monophasique de Typhimurium 43%S. Typhimurium 12%

S. Derby 30%S. Rissen 8%S. Infantis 2%

Page 12: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Rencontres scientifiques de l’Anses13/11/18

Salmonella spp.

- Résistances variables selon le sérovar

- Salmonella Infantis : multisensible

- % de résistance élevés à très élevés : tétracycline (Salmonella spp.), ampicilline (Typhimurium et son variant monophasique)

- Sensibles aux C3G, carbapénèmes, azithromycine et colistine

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 13: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

13

https://info.agriculture.gouv.fr/gedei/site/bo-agri/instruction-2018-796

Dispositif général Spécifications techniques 2017 Résultats 2017 Perspectives 2019

Page 14: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Nouvelle législation sur la surveillance harmonisée de l’antibiorésistance

Nouvelle organisation LNR Résistance Antimicrobienne

Page 15: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

15

Directive 2003/99/ECArt. 7(3) and 9(1) + Annexes II (B) IV

EU Implementing Legislation:

Decision 2013/652/EU2014 - 2020

Monitoring AMR: Legal and Technical Bases

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of AMR in

Salmonella, Campylobacter,indicator commensal E. coli and

Enterococcus spp. transmitted throughfood

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of MRSA in

food-producing animals and food

EFSA Tech. Spec. on randomisedsampling for harmonised monitoringof AMR in zoonotic and commensal

bacteria

2012

2014

EFSAScientific Opinions

on AMR

. EQAAs (AST)

. Protocols

Harmonisation. Susceptibility Testing (microdilution). Set of substances tested and dilution ranges. Interpretative criteria of resistance (ECOFFs). Representative sampling designs

2011-2016Action Plan against

the rising threats of AMR

© PA Beloeil 2018

Page 16: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

16

2011-2016Action Plan against

the rising threats of AMR

Outcome

Directive 2003/99/ECArt. 7(3) and 9(1) + Annexes II (B) IV

Decision 2013/652/EU2014 - 2020

New Decision2021 - …

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of AMR in

Salmonella, Campylobacter,indicator commensal E. coli and

Enterococcus spp. transmitted throughfood

EFSA Tech. Spec. on the harmonisedmonitoring and reporting of MRSA in

food-producing animals and food

EFSA Tech. Spec. on randomisedsampling for harmonised monitoringof AMR in zoonotic and commensal

bacteria

June 2017 The European ‘One Health’ Action Plan against AMR

New EFSA Tech. Spec. on the harmonised monitoring of AMR in bacteria transmitted through food

by March 2019

2012

2014

2019

2016 – 2017 - 2018Audits of implementationin the MSs by Dir. F ofDG SANTE of the EC

2019-2020: Drafting of the legislation by the EC

2020: Negotiation EC - MSs© PA Beloeil 2018

Page 17: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Propositions du GT EFSA pour 2021-…

Espèces animales : rotation bisuannuelle conservée

Espèces bactériennes : Campylobacter coli obligatoire

Panels d’antibiotiques : révisions mineures

WGS en complément de la surveillance phénotypique

Page 18: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Organisation du LNR Résistance Antimicrobienne depuis 2015

CampylobacterSalmonella spp E. coli

Page 19: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Organisation du LNR Résistance Antimicrobienne en 2019

CampylobacterSalmonella spp E. coli

Page 20: Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques ...Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats 2018 en France

Remerciements

Les Services Déconcentrés

Les Laboratoires agréés

Sabine ItiéCécile Adam

Anses FougèresAnses Maisons-Alfort

Anses LyonAnses Ploufragan

Jean-Philippe AmatMathilde Saussac

Agnès Perrin

Questions ? [email protected] ou [email protected] ou [email protected]

Pierre-Alexandre Beloeil