Keanekaragaman Mikrobia

Objek kajian Mikrobiologi

Studi mikrobia disatukan oleh pendekatan yang unik yaitu Teknik

Studi mikrobiologi: teknik kultur murni yang dicapai dengan teknik kerja

aseptis

Keanekaragaman Mikrobia

Ruang lingkup mikrobia:

Arkhaea Bakteria Protista (Protozoa, Algae, Slime molds, Water molds)

Fungi Virus (mikrobia aselular)

Keanekaragaman Mikrobia

Mikrobia: Bakteria (23 Phylum)Arkhaea (2 Phylum)Fungi (4 Phylum)Protozoa ( 10 Phylum)Algae (Chromista= 10 Phylum)Virus (71 Familia)

Studi keanekaragaman Mikrobia:Pendekatan taksonomis

• Bakteriologi

• Protozoologi

• Fikologi

• Mikologi

• Virologi

Konsep Keanekaragaman Hayati

Keanekaragaman genetik Keanekaragaman spesies Keanekaragaman ekosistem

Kaekaragaman genetikVariasi unit gen yang dimiliki oleh setiap

individu atau strainVariasi antar strain mikrobia dalam satu

spesiesKategori takson di bawah spesies:Biovar (fisiologis)Serovar (serologis)Patovar (patogenisitas)Phagovar (sensitivitas terhadap phage)

Deteksi Keanekaragaman Genetik

Nilai G-C contentDNA-DNA relatednessDNA sequencing (rDNA)DNA fingerprinting (RFLP, RAPID, ARDRA)

Kaekaragaman spesies

Banyaknya spesies mikrobiaTergantung pada konsep spesies:Taxospecies conceptGenomic species conceptGenospecies conceptNomenspecies concept

Kaekaragaman Ekosistem Adanya berbagai ekosistem: Ekosistem salju Ekosistem hutan hujan tropis Ekosistem hutan bakau Ekosistem padang rumput Ekosistem gurun Ekosistem mata air panas

Faktor penentu adanya berbagai ekosistem: Komponen non-biotik (fisikawi & kiiawi) Komponen biotik (komunitas: mikrobia, tumbuhan &

hewan)

Keanekaragaman Mikrobia

1. Sistem Klasifikasi Arkhaea

2. Sistem Klasifikasi Bakteria

3. Sistem Klasifikasi Protozoa, Slime molds & Algae

4. Sistem Klasifikasi Khromista (Algae & Water molds)

5. Sistem Klasifikasi Fungi