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MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL UTL ASESORA: Página 17/16 ÁREA DE SUSTENTABILIDAD PARA EL DESARROLLO PROGRAMA ACADÉMICO DE QUÍMICA ESPECIALIDAD TECNOLOGIA AMBIENTAL GRUPO QU-301 MATERIA MICROBIOLOGIA AMBIENTAL TITULO AISLAMIENTO E IDENTIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS DE LA MATRIZ AMBIENTAL: ___SUELO______ ASESORA Dra. ROSA RICO MATA DATOS DE IDENTIFICACIÓN DE LOS ANALISTAS Fecha de inicio del análisis: 1 de julio de 2015 Fecha de término: 13 de julio de 2015 Nombre Cargo Cruz Romo Diana Laura Responsable González Sánchez Carla Valeria Administrador Gaona Aboytes María Alejandra Laboratorista 1 Mireles Villasana Alejandra Laboratorista 2 Pérez Gómez Cynthia Sarai Laboratorista 3 GENERACIÓN: 2014-2016

Retroalimentación Matriz Suelo

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Pruebas bioquímicas de la matriz suelo

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ÁREA DE SUSTENTABILIDAD PARA EL DESARROLLOPROGRAMA ACADÉMICO DE QUÍMICA

ESPECIALIDAD TECNOLOGIA AMBIENTAL

GRUPO

QU-301

MATERIA

MICROBIOLOGIA AMBIENTAL

TITULO

AISLAMIENTO E IDENTIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS

DE LA MATRIZ AMBIENTAL: ___SUELO______

ASESORA

Dra. ROSA RICO MATA

DATOS DE IDENTIFICACIÓN DE LOS ANALISTASFecha de inicio del análisis: 1 de julio de 2015Fecha de término: 13 de julio de 2015

Nombre Cargo Cruz Romo Diana Laura Responsable

González Sánchez Carla Valeria Administrador

Gaona Aboytes María Alejandra Laboratorista 1

Mireles Villasana Alejandra Laboratorista 2

Pérez Gómez Cynthia Sarai Laboratorista 3

GENERACIÓN: 2014-2016

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DATOS DEL SITIO EN ESTUDIO1.- Breve descripción del estatus ambiental del sitio de estudio: Es una presa en la cual desembocan todo tipo de desechos industriales y domésticos, y su destino final es para el riego de alfalfa y lechuga, estas aguas están fuertemente contaminadas química y bacteriológicamente, al no sufrir ningún tratamiento de remediación en el lugar hay diversos tipos de plantas así como diferentes zonas de cultivos a los alrededores de la presa, en la zona están presentes diferentes tipos de suelo y a pesar de que haya suelo fértil es regado con agua contaminada.

SITIO DE MUESTREO

Nombre Ubicación /coordenadas GPS

Imagen de mapa satelital

Presa Blanca Ubicada al sureste del municipio de León en el estado de Guanajuato.Coordenadas:21° 5'10.97"N

101°42'35.19"O

2. Evidencia fotográfica del sitioFecha: 11/10/2015Hora: 10:32 am

Fecha: 11/06/2015Hora: 10:34 am

DATOS DE LAS MUESTRAS A ANALIZAR

1. Identificación

Matriz ambiental: Suelo Fecha y hora de toma de muestra: 11/06/15 a las 12:02 pm

Fecha y hora de siembra: 01/07/15 a las 10:36 am

Punto de Muestreo (ubicación /coordenadas GPS): 21° 5’ 40.97” N 121° 42’ 39.98” O

Tiempo de exposición (aplica solo para muestra de aire)

Nombre del/ los analistas que tomaron la muestra:Diana Eréndira Uribe Juárez

Nombre del/ los analistas que sembró la muestra:Diana Eréndira Uribe Juárez

2.Parámetros Fisicoquímicos Color: café oscuro Temperatura (oC) ambiental: 23.4°C pH: 6.5

Olor: a humedad Describir condiciones climatológicas:Temperatura de 24°C, soleado

3. Evidencia fotográfica del sitio de toma de muestra

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AISLAMIENTO DE MICROORGANISMOS1. Justificación del proceso para la identificación bacteriana

La identificación bacteriana se realizó mediante pruebas bioquímicas debido que estas son un conjunto de reacciones que determinan la actividad de una vía metabólica de la bacteria a partir de un sustrato que se incorpora en un medio de cultivo y que la bacteria al crecer transforma o no, también si existe o no fermentación. Para ello es necesario partir de un cultivo puro obtenido en el aislamiento, resembrado una colonia bien aislada. Entonces esto permite estudiar las características generales de la bacteria, su metabolismo, etc., lo que nos permitirá conocer los beneficios o perjuicios que aporta al ambiente, lo que dará pauta a tomar decisiones o precauciones , por ejemplo saber la bacteria es capaz para utilizarse en un tipo de biorremediación.

2. Dos medios de siembra (Nombre y Composición)

Morfología Colonial (Medio 1) Morfología Colonial (Medio 2)Descripción

En este medio se pueden observar colonias verdosas con brillo metálico y centro negro azulado, rosas púrpura, incoloras, puntiformes, de forma circular o sin forma específica ya que se forman agrupamientos, con contorno redondeado, elevación convexa, mucosas, con aspecto semihumedo, pequeñas o grandes, con superficie lisa.

Descripción

En este medio pueden crecer colonias color rosa a rojo, incoloras a color rosa o incoloras con en centro anaranjado a ámbar , puntiformes, de forma circular o irregulares, de superficie convexa, planas convexas o papilada con borde redondeado u ondulado, colonias mucoides , inhibición de agrupamiento dinámico alrededor de colonias aisladas.

Imagen Imagen

(1) Agar EMB (agar eosina azul de metileno)

Fórmula* por litro de agua destilada

Digerido pancreático de gelatina…..10.0 g Lactosa…..5.0 g Sacarosa…..5.0 gFosfato dipotásico…..2.0 g Agar…..13.5 gEosina…..0,4 gAzul de metileno…..0.065 g

(2) Mac ConkeyFórmula* por litro de agua destiladaGelatina digerida por enzimas pancreáticas……17 g Caseína digerida por enzimas pancreáticas……1.5 g Tejido animal digerido por enzimas peptídicas…..1.5 gLactosa……10 g Sales biliares……..1.5 g Cloruro de sodio…..5 gRojo neutro…..0.03 g Violeta cristal…..0.001 g Agar…..13.5 g

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3. Dos Medios selectivos de resiembra (Nombre y Composición)

Morfología Colonial (Medio 1) Morfología Colonial (Medio 2)

Descripción

En este medio se pueden observar colonias verdosas con brillo metálico y centro negro azulado, rosas púrpura, incoloras, puntiformes, de forma circular o sin forma específica ya que se forman agrupamientos, con contorno redondeado, elevación convexa, mucosas, con aspecto semihumedo, pequeñas o grandes, con superficie lisa.

Descripción

En este medio pueden crecer colonias incoloras, rosadas, rojas con halo de precipitación rojizo, su elevación puede ser convexa o plana-convexa, puntiformes, de formar circular, borde redondeado u ondulado, superficie lisa, con aspecto húmedo o semihumedo, de consistencia blanda con elevación convexa o planoconvexa.

Imagen Imagen

(1) Agar EMB (agar eosina azul de metileno)

Fórmula* por litro de agua destilada

Digerido pancreático de gelatina…..10,0 g Lactosa…..5,0 g Sacarosa…..5,0 gFosfato dipotásico …..2,0 g Agar 13,5….. gEosina…..0,4 gAzul de metileno 0,065…..g

(2) Agar bilis rojo violeta Fórmula* por litro de agua destilada

Extracto de levadura........3,0 g Peptona......7,0 gLactosa.........10,0 g Cloruro de sodio.........5,0 gRojo neutro.......0,03 g Cristal violeta......0,002 g Agar.......15,0 g

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4. Procedimiento de Aislamiento(describir detalladamente la cantidad de materiales y los pasos a seguir)

Materiales/Reactivos/Medios de cultivo/ Equipo a utilizar2 Cajas Petri 1 Asa de nicromo 1 Mechero Bunsen 1 Matraz Erlenmeyer 1 Charola de pesado 1 Espátula Algodón Autoclave Agar EMB (Eosina y Azul de Metileno)Agar MacConkey

Preparación de medios de cultivoAgar EMBPesar 2.88 g del medio y suspender el polvo en 80 mL de agua destilada. Reposar 5 minutos; mezclar, calentando a ebullición durante 1 o 2 minutos hasta su disolución. Esterilizar en autoclave a no más de 121°C durante 15 minutos. Enfriar a 45°C y distribuir a las dos placas de Petri agitando suavemente el medio. Agar MacConkeySuspender 4 g del medio y suspender el polvo en 80 mL de agua destilada. Reposar 5 minutos y mezclar hasta uniformar. Calentar suavemente y hervir 1 a 2 minutos hasta disolver. Esterilizar en autoclave a 121°C durante 15 minutos. Enfriar y distribuir a las dos placas de Petri agitando suavemente el medio.

Pasos para el aislamiento del microorganismos (siembra, selección de la colonia y resiembra):Siembra

1. Flamear el asa bacteriológica con ayuda de un mechero bunsen hasta que esté al rojo vivo (para eliminar cualquier microorganismo) y dejarla enfriar.

2. Tomar la muestra de suelo con el asa estéril, abrir la caja de Petri con un ángulo de 45° (mantenerla siempre cerca del mechero para evitar contaminación) y sembrarla en forma de estría (pasar el asa a través de la superficie de la caja con agar EMB, con movimientos en forma de “s” de tras hacia adelante) y rastreando la siembra en la caja Petri. Como se muestra a continuación. (Figura 1)

3. Rotular la caja Petri y meter a incubar en la posición en la que se encuentra a 37°C por 24 horas.

Figura 1. Forma de estriar para el aislamiento.

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Resiembra

1. Flamear el asa bacteriológica en el mechero Bunsen, hasta que el asa quede de color rojo (para eliminar cualquier microorganismo).

2. Dejar enfriar por pocos segundos y levantar la caja de Petri en un ángulo de 45°. 3. Tomar la azada de la colonia seleccionada más separada de la siembra en agar EMB (cerca del área

estéril del mechero) y hacer una serie de estrías (Figura 2) sobre la superficie de la placa que contiene agar EMB flamear el asa cada vez que se vaya a realizar un estriado. Si es necesario estar girando la placa para realizar las estrías.

4. Rotular la caja de Petri e incubarlas a 37° C por 24 horas

Figura 2. Técnica para el aislamiento por estría.

Indol -

Catalasa +

Rojo de metilo +

H2S +

TSI ±

Citrato ±

Bacteria a identificar

Gramm - Gramm +

Movilidad - Movilidad +

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5. Esquema del Perfil bioquímico (metabólico ) para la identificación del microorganismo seleccionado

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RESULTADOS DEL AISLAMIENTO E IDENTIFICACIÓN

1. EVIDENCIA FOTOGRAFICA DEL CULTIVO DE LA MUESTRA (SIEMBRA)

2. MORFOLOGÍA COLONIAL OBSERVADATipo de colonia 1: Descripción

Colonias color rosa claro, elevadas, crecimiento por agrupamientos, de borde ondulado o entero, superficie

rugosa, con aspecto húmedo y consistencia blanda. Presencia de burbujeo de gas.

FOTO 1

Tipo de colonia 2: Descripción

Colonias un poco más aisladas, incoloras con una reflexión de luz mate, de forma circular y elevación

convexa, aspecto semihumedo, borde entero u ondulado.

FOTO 2

Tipo de colonia 3: Descripción

Colonias de color café oscuro a simple vista, puntiformes, con elevación convexa, superficie lisa y con

borde entero u ondulado.

Colonia seleccionada para su identificación

FOTO 3

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3. EVIDENCIA FOTOGRAFICA DEL CULTIVO PURO ( RESIEMBRA)FOTO 1: Colonia que se resembró Agar EMB (agar eosina

azul de metileno)FOTO 2: Cultivo puro Agar bilis rojo violeta

4. MORFOLOGIA COLONIAL OBSERVADA

Descripción

Colonias pequeñas de color rosa aunque a simple vista se ven de un color café oscuro, de forma circular, su elevación es convexa y tiene un borde redondeado su aspecto es casi seco, superficie lisa.

FOTO 1

FOTO 2

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5. EVIDENCIA FOTOGRÁFICA DEL RESULTADO DEL PERFIL BIOQUÍMICO

Nombre de la prueba

Medio de cultivo utilizado

Resultado obtenido (positivo/negativo) Evidencia fotográfica

1.- Tinción de Gram

N/A Negativo

Fundamento de la pruebaSe utiliza para poder diferenciarse la morfología celular bacteriana que radica en la diferente estructura de la pared celular de ambos grupos: las bacterias Gram+ tienen una gruesa capa de peptidoglicano en su pared, mientras que las bacterias Gram- tienen una capa de peptidoglicano más fina y una capa lipopolisacarídica externa. Tras la tinción con el primer colorante (Cristal violeta) se efectúa un lavado con etanol que arrastrará al colorante sólo en las Gram (-), mientras que las Gram (+) y se tiñen de color purpura. Las células Gram (-) se teñirán después con un colorante de contraste (safranina) para que puedan observarse.Considerándose gram positiva a las que se visualizan de color moradas y gram negativas a las que se visualizan de color rosa o rojo.

2.- Movilidad Medio SIM Negativo

Fundamento de la pruebaLas bacterias tienen movilidad por medio de sus flagelos, que se encuentran principalmente entre los bacilos; sin embargo algunas formas de cocos son inmóviles. Las bacterias móviles pueden contener un solo flagelo o muchos; además su localización varía con su especie bacteriana y las condiciones de cultivo. A veces, las bacterias con movilidad producen variantes no móviles que parecen ser estables y raramente se revierten en formas móviles. Los organismos no móviles carecen de flagelos, en el caso del medio SIM (medio semisólido) los microorganismos móviles pueden apreciarse por la turbidez que producen alrededor de la punción de siembra.

Muestra

Control (sin

muestra)

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3.- Catalasa N/A Negativo

Muestra

Control (sin muestra)

PRUEBA DEL CITRATOCitrato de sodio Productos metabólicos alcalinos (carbonatos y bicarbonatos) –TpH

Azul de bromotimol Azul de bromotimol (verde) (azul) pH 6.9 pH 7.6

Enzima

Muestra

Control (sin muestra)

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Fundamento de la pruebaLa enzima catalasa descompone el peróxido de hidrógeno (H2O2) en agua y oxígeno bajo la fórmula 2 H2O2----2 H2O + O2. De esta manera las bacterias se protegen del efecto tóxico del H2O2, que es un producto final del metabolismo aerobio de los azúcares.Permite diferenciar: A) géneros: Streptococcus (-) de Micrococcus (+) y/o Staphylococcus (+); Bacillus (+) de Clostridium (-) y Corynebacterium (+) de Erysipelothrix (-), siendo excepciones en este último caso, Corynebacteriumpyogenes (-) y Corynebacteriumhaemolyticum (-). B) especies: Moraxellabovis (variable) y Moraxellakingii (-) de otras especies de Moraxella (+).

4.- Producción de citrato de permeasa

Agar citrato No hubo crecimiento

Fundamento de la pruebaEl medio de cultivo es diferencial en base a que los microorganismos capaces de utilizar citrato como única fuente de carbono, usan sales de amonio como única fuente de nitrógeno, con la consiguiente producción de alcalinidad.El metabolismo del citrato se realiza, en aquellas bacterias poseedoras de citrato permeasa, a través del ciclo del ácido tricarboxílico. El desdoblamiento del citrato da progresivamente, oxalacetato y piruvato. Este último, en presencia de un medio alcalino, da origen a ácidos orgánicos que, al ser utilizados como fuente de carbono, producen carbonatos y bicarbonatos alcalinos. El medio entonces vira al azul y esto es indicativo de la producción de citrato permeasa.

5.- Producción de ácido sulfhídrico

Medio SIM No hubo crecimiento

Control (sin

muestra)

Blanco

Muestra

H2O2 H2O + OH

Catalasa H2O2 +e- +H+ H2O+OH+

Control (sin muestra)

Muestra

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Fundamento de la pruebaAlgunos microorganismos tienen enzimas que desprenden el átomo de azufre de aminoácidos trptófano, el cual es luego reducido con hidrógeno (de los substratos), para formar ácido sulfhídrico las enzimas responsables de esta actividad son la cisteína, desulfhidrasa y la tiosulfato reductasa, en este proceso los microorganismos cumplen con la actividad que puede catalogarse como fermentación proteica. La actividad de las bacterias sobre aminoácidos que contienen azufre, frecuentemente produce liberación de sulfhídrico, lo cual se demuestra empleando sales de metales pesados como el hierro. El sulfhídrico reacciona con tales metales dando una coloración oscura al medio de cultivo.Para detectar la capacidad de producir sulfhídrico, utilizamos también el medio de Kliger, el medio contiene tiosulfato de sodio como sustrato necesario para la producción de sulfhídrico, citrato de hierro y amonio como fuente de iones de Fe+3 que se combinan con el ácido sulfhídrico y producen sulfuro de hierro que se observa como un precipitado en el medio de color negro que es la producción de ácido sulfhídrico.

Bacteria enmedio+Na2S2O3→H2S gasH 2S+iones ferricos→Fes (pp negroinsoluble)

6.- Fermentación de lactosa

Agar TSI No hubo crecimiento

Fundamento de la pruebaTambién conocida coma fermentación heteroláctica se denomina así porque su producto final no es exclusivamente ácido láctico.El proceso tiene un rendimiento menor al de la fermentación homoláctica como se desprende de la producción de solo un mol de ATP por mol de glucosa fermentada.La obtención de piruvato en bacterias se logra mediante el catabolismo de la glucosa por la ruta e las pentosas.Su reacción es: Glucosa + ADP +Pi Ac. Láctico + etanol + CO2 + ATP

Si la bacteria problema fermenta lactosa o sacarosa, acidificara el medio en su superficie volviéndolo de color amarillo, mientras que si no lo es, la superficie del medio continuara de color rojo.

Control sin muestraMuestra

Control sin muestra

Muestra

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7.- Fermentación de glucosa

Agar TSI No hubo crecimiento

Fundamento de la prueba

Es una ruta metabólica anaeróbica que ocurre en el citosol de la célula, en la cual se oxida parcialmente la glucosa para obtener energía y donde el producto de desecho es el ácido láctico.En este tipo de fermentación, la molécula de glucosa (de 6 átomos de carbono) se degradan y forma dos moléculas de ácido láctico (de 3 átomos, cada una) como único producto final. Su ecuación global es:

Glucosa + 2ADPA + 2Pi 2 lactato + 2ATP + 2 H2OSi la bacteria problema fermenta la glucosa, acidificara el medio haciendo virar a amarillo el indicador en el fondo del tubo, mientras que si no es fermentadora de glucosa, el medio permanecerá de color rojo.

8.- Fermentación de sacarosa

Agar TSI No hubo crecimiento

Fundamento de la pruebaEs una prueba usada para la fermentación de sacarosa por parte de la bacteria sumándole producción de gas. Superficie acida/profundidad acida (pico amarillo/ fondo amarillo) fermenta sacarosa, si la superficie es alcalina/ profundidad alcalina (pico rojo/fondo rojo) no fermenta sacarosa. La presencia de burbujas o ruptura del medio de cultivo produce gas (CO2).

Sacarosa (C12H22O11)+H2O Glucosa(C6H12O6)+ Fructosa(C6H12O6)

9.- Rojo de metilo, Fermentación Acido-

mixta

Caldo RMVP Negativo

Control (sin muestra)

Muestra

Trp Indol+Ac. Pirúvico +NH3

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Fundamento de la pruebaDeterminar la capacidad de un microorganismo para producir y mantener estables los productos terminales ácidos de la fermentación de la glucosa y vencer la capacidad amortiguadora del sistema. Las bacterias que utilizan la glucosa por la vía ácido mixta generan como productos finales ácido acético, ácido fórmico, ácido succínico y ácido láctico, los cuales provoca un fuerte descenso en el pH del medio, La prueba Rojo de metilo es cuantitativa para la producción de ácido y requiere que los microorganismos produzcan ácidos fuertes a partir de la glucosa, de forma que el medio del pH descienda a menos de 4.4. Esta distinción puede hacerse a través del indicador Rojo de metilo que presenta color amarillo por encima de un pH de 5.1 y solo presenta color rojo cuando el pH desciende a 4.4.

10.- Indol Medio SIM No hubo crecimiento

Fundamento de la pruebaLa prueba del indol se genera mediante la desaminación reductiva del triptófano y esta reacción es llevada a cabo por algunas bacterias que poseen las enzimas denominadas en su conjunto triptofanasas. Para detectar la producción de indol se utiliza el medio Caldo triptófano y la lectura de la prueba se realiza con el reactivo de Kovacs (alcohol isoamilo, p-dimetilaminobenzaldehído y ácido clorhídrico concentrado) con el que el indol producido reacciona generando una coloración rosa intensa.

IDENTIFICACIÓN DEL MICROORGANISMO AMBIENTAL

EN LA MATRIZ DE ESTUDIO: __SUELO__

Triptofanasa

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1.- Nombre científico del o los microorganismo identificado de acuerdo a los resultados del perfil bioquímico planteado ( género y especie)

Los resultados de las pruebas bioquímicas realizadas a nuestro microorganismo aislado corresponde al perfil bioquímico de la bacteria Klebsiella pneumoniae. Sin embargo no es definitivo ya que en algunas pruebas bioquímicas como la fermentación de lactosa, glucosa y lactosa, en medio TSI, no se obtuvo crecimiento por lo que se puede concluir un resultado conciso de esta prueba. En base a los resultados favorables que obtuvimos podemos decir que el microorganismo identificado es:

Klebsiella pneumoniae

2. Taxonomía del o los microorganismo identificadosDominio: bacteria

Filo: ProteobacteriaClase :Gammaproteobacteria

Orden: EnterobacterialesFamilia: Enterobacteriaceae

Género: KlebsiellaEspecie: K. pneumoniae

3. Características generalesKlebsiella es una bacteria gram-negativa, una bacteria en forma de varilla y no móviles de familia Enterobacteriaceae. Es un anaerobio facultativo, y tiene una característica de ser tanto aeróbica como anaeróbica, dependiendo de la situación, la asimilación y la fermentación de la lactosa se puede observar en el agar MacConkey donde las colonias son de color rosado y en el medio Kliger o TSI donde son Ácido/Ácido, es decir fermentador de la lactosa más producción de gas; y en la fermentación acetónica o prueba de Voges Proskauer son positivos. Por último, sus condiciones óptimas de cultivo son en agar nutritivo a 37 °C, pH de 7.0, presión osmótica de 1 atm, esta bacteria se encuentra de forma natural en el suelo, el agua y las verduras (las coles, lechuga, vegetales de hojas verdes, etc.). Es la especie de mayor relevancia clínica, desempeñan un importante papel como causa de las enfermedades infecciosas oportunistas . El género fue llamado así en honor a Edwin Klebs, un microbiólogo alemán de finales del siglo XIX. El bacilo ahora conocido como Klebsiella pneumoniae también fue descrito por Karl Friedländer, y durante muchos años se conoció como el bacilo de Friedländer.

4. Ciclo(s) biogeoquímicos en el(los) que intervienenCiclo biogeoquímico del nitrógeno.

5. La función que juegan en la transformación de la materia orgánica a través de los ciclos biogeoquímicos

El papel que juegan las bacterias es en la fijación del nitrógeno molecular a amoniaco.Esta incorporación de nitrógeno a la biosfera ocurre gracias a la existencia en las bacterias fijadoras de la enzima nitrogenasa, capaz de realizar en las condiciones ambientales normales, una reacción química que requiere más de 800º de temperatura y bastantes atmósferas de presión.Este proceso microbiano es llevado a cabo por organismos procarióticos en vida libre o en simbiosis, esto último si ocurre en asociación mutualista con las plantas. Hay una gran representación de especies microbianas portadoras de esta característica pertenecientes a muy diferentes grupos de bacterias.

Se trata de un proceso altamente consumidor de energía. El triple enlace que une los dos átomos de nitrógeno es duro de romper. El trabajo es llevado a cabo por la enzima nitrogenasa con el consumo de 16 moléculas de ATP por N2 reducido, según la ecuación:

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N2 + 16ATP + 8e- + 8H+ = 2NH3 + 8H2 + 16ADP + 16Pi

La fijación de nitrógeno es un proceso altamente consumidor de energía. La reducción y la provisión de los electrones necesarios requieren el consumo de bastantes moléculas de ATP, hasta 24 por N 2, por lo que la eficiencia del proceso es bastante baja, como se manifiesta en el caso de los fijadores libres.

La reducción del nitrógeno molecular a amoniaco es catalizada por un complejo enzimático conocido como nitrogenasa y el nitrógeno molecular es el principal depósito de nitrógeno para los organismos vivos.La fijación biológica del nitrógeno, es llevada a cabo por bacterias capaces de tomar nitrógeno y combinarlo por medio de enzimas. Algunas de estas bacterias viven libres en el suelo, y otras forman simbiosis con algunos tipos de plantas.Estos microorganismos aeróbicos protegen la nitrogenasa mediante: la remoción de oxígeno por el proceso de respiración; ej. En Azotobacter y Klebsiella, se observan cadenas de transporte abreviadas que rinden menos ATP por molécula de sustrato oxidado, generándose un aumento en el consumo de oxígeno por molécula de sustrato oxidado; o mediante asociación sinergística con bacterias heterotróficas aerobias, como es el caso de la relación entre Anabaena y Pseudomonas aeruginosa.

6. Conclusión parcial sobre las interacciones bacterianas en la matriz estudiada y la importancia de la microbiología en el área ambiental

Al realizar esta práctica fue posible adquirir conocimientos tales como: preparación de material y medios de cultivo, toma de muestra, diferentes técnicas de siembra y resiembra y también fue posible la realización de diferentes pruebas bioquímicas como catalasa, indol, movilidad, fermentación de lactosa, glucosa y sacarosa, entre otras, las cueles sirvieron para conocer algunas bacterias que se encuentran en el medio ambiente ya que las pruebas bioquímicas son un conjunto de reacciones que nos permiten determinar la actividad metabólica de la bacteria a partir de un sustrato (presente el medio de cultivo) y que la bacteria al crecer puede transformarlo o no, entonces esos cambios que produce la bacteria nos permite determinar si la prueba es positiva o negativa, para ello es necesario partir de un cultivo puro previamente obtenido del aislamiento.

También entendimos la importancia que tiene la buena ejecución de las pruebas bioquímicas ya que para ello es necesario realizar todo con pleno consentimiento y con los cuidados, precauciones y factores necesarios. Así como la importancia que tienen para identificar microorganismos debido al su metabolismo que muestran es los resultados de cada prueba.

La aplicación de la microbiología ambiental nos ayudó identificar microorganismos existentes en las matrices ambientales (específicamente suelo), a comprender la importancia, intervención y función que tienen los microorganismos identificados en diversos ámbitos por ejemplo en los ciclos biogeoquímicos, en la transformación de los componentes orgánicos e inorgánicos, incluyendo los contaminantes, etc. Además los daños y beneficios que pueden causar las bacterias al ambiente, y como a partir de ello se pueden elegir diferentes tipos de microorganismos de acuerdo a su metabolismo para realizar o aplicar procesos de biorremediación o algún otro proceso con la finalidad de mejorar la situación ambiental.

Con la práctica reafirmamos nuestros conocimientos obtenidos en clase referente a los microorganismos presentes en el suelo y a preciar de forma real sus características como sus tipos de respiración, fermentación, etc.

Por lo tanto podemos concluir que en el suelo existen relaciones entre una gran variedad de microorganismos, siendo los microorganismos los componentes más importantes del suelo, ya que constituyen la parte viva de este y son los responsables de la dinámica de transformación y desarrollo.

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Pudimos darnos cuenta que la capacidad de multiplicación les permite crear poblaciones muy grandes en un tiempo muy corto, colonizando rápidamente los sustratos a degradar, como pudimos observar en cada prueba bioquímica realizada en el laboratorio microbiológico.

Entendimos que la interacción bacteriana puede generar que los grupos bacterianos que actúan primero sobre los sustratos disponibles sean dominantes hasta que termina su acción y luego dan oportunidad a que otros grupos crezcan en el residuo del metabolismo de los primeros.