Avlsplaner med eller uden genomisk selektion og afkomsundersøgelse

L.H. Buch, M.K. Sørensen, P. Berg, L.D. Pedersen og A.C. Sørensen

Optimering af avlsplaner

Maksimere årlig genetisk fremgang for det samlede avlsmål

Bevare indavlsstigningen under en given grænse (f.eks. 1% pr. generation)

Avlsplaner uden genomisk selektion

Sammenhæng mellem sikkerhed og generationsinterval

Nogle egenskaber har lave heritabiliteter

Næsten alle egenskaber registreres kun på hundyrene

Afkomsundersøgelse har været almen praksis

L

riG AIH

Avlsplaner med genomisk selektion

Genomiske avlsværditalModerate til høje sikkerheder

Kan estimeres på alle selektionskandidater uanset alder

Sammenhængen mellem sikkerhed og generationsinterval er svagere

Scenarier

Avlsplan AFK GEBV

Traditionel + -

Ungdyr - -

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Scenarier

Avlsplan AFK GEBV

Traditionel + -

Ungdyr - -

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Scenarier

Avlsplan AFK GEBV

Traditionel + -

Ungdyr - -

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Scenarier

Avlsplan AFK GEBV

Traditionel + -

Ungdyr - -

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Generelle forudsætninger for alle avlsplaner

MOET på de 400 bedste hundyr → 5 kalve hver

De 30 bedste tyre anvendes i avlen hvert år

Heritabiliteter og genetiske korrelationer

Egenskab Proteinydelse Mastitisresistens

Proteinydelse 0,30 -0,30

Mastitisresistens 0,04

Afkomsundersøgelse

Med afkomsundersøgelse:200 1-årige tyre bliver afkomsundersøgt pr. år

Tyrene bliver først anvendt i avlen efter de er afkomsundersøgt

Uden afkomsundersøgelse:Tyrene bliver anvendt i avlen så snart de er kønsmodne

Generationsintervallet i år (GI)

Avlsplan AFK GEBV GI

Traditionel + - 4,7

Ungdyr - - 2,7

Præ-selektion + + 4,6

Turbo - + 2,4

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Genomisk selektion

Genotypninger pr. år2000 1-årige tyre

2000 1-årige kvier

Sikkerhed på 50 % for begge egenskaber og alle dyr

Årlig genetisk fremgang (ΔG)

Avlsplan AFK GEBV ΔG

Traditionel + - 100

Ungdyr - - 109

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Realiserede sikkerheder på indekset og generationsintervallet i år (GI)

Avlsplan AFK GEBVSikkerhed

for brugstyreGI

Traditionel + - 0,69 4,7

Ungdyr - - 0,20 2,7

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Årlig genetisk fremgang (ΔG)

Avlsplan AFK GEBV ΔG

Traditionel + - 100

Ungdyr - - 109

Præ-selektion + + 129

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Realiserede sikkerheder på indekset

Avlsplan AFK GEBVSikkerhed

for ungtyre

Sikkerhed

for tyremødre

Traditionel + - 0,08 0,12

Ungdyr - -

Præ-selektion + + 0,37 0,24

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Årlig genetisk fremgang (ΔG)

Avlsplan AFK GEBV ΔG

Traditionel + - 100

Ungdyr - - 109

Præ-selektion + + 129

Turbo - + 202

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Realiserede sikkerheder på indekset og generationsintervallet i år (GI)

Avlsplan AFK GEBVSikkerhed

for brugstyre

Sikkerhed

for tyremødreGI

Traditionel + - 0,69 0,12 4,7

Ungdyr - -

Præ-selektion + +

Turbo - + 0,45 0,32 2,4

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Genetisk fremgang for proteinydelse (ΔGProtein) og mastitisresistens (ΔGMastitis) i genetiske standard afvigelser

Avlsplan AFK GEBV ΔGProtein ΔGMastitis

Traditionel + - 0,18 0,09

Ungdyr - - 0,19 0,11

Præ-selektion + + 0,20 0,15

Turbo - + 0,29 0,25

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Genetisk fremgang for proteinydelse (ΔGProtein) og mastitisresistens (ΔGMastitis) i kg protein og færre tilfælde pr. ko

Avlsplan AFK GEBV ΔGProtein ΔGMastitis

Traditionel + - 2,5 0,017

Ungdyr - - 2,7 0,019

Præ-selektion + + 2,9 0,027

Turbo - + 4,2 0,046

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

Indavlsstigning pr. generation i procent (ΔF)

Avlsplan AFK GEBV ΔF

Traditionel + - 1,15

Ungdyr - - 2,55

Præ-selektion + +

Turbo - +

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

122%

Familieselektion

Antal udvalgte sønner

0

2

4

6

8

10

A B C D E F G H I J

Afstamningsinformation

Tyrefamilie

Reduceret familieselektion

Antal udvalgte sønner

0

2

4

6

8

10

A B C D E F G H I J

Afstamningsinformation

Information om mendelsk udspaltning

Tyrefamilie

Indavlsstigning pr. generation i procent (ΔF)

Avlsplan AFK GEBV ΔF

Traditionel + - 1,15

Ungdyr - - 2,55

Præ-selektion + + 0,48

Turbo - + 0,74

AFK = Afkomsundersøgelse; GEBV = Genomiske avlsværdital

-36%

-58%

Konklusion

Avlsplaner med genomisk selektionGiver større genetisk fremgang pr. år

især turboplanen

Resulterer i lavere indavlsstigning pr. generationisær præ-selektionsplanen

Konklusion

Avlsplaner med genomisk selektionGiver større genetisk fremgang pr. år

især turboplanen

Resulterer i lavere indavlsstigning pr. generationisær præ-selektionsplanen

Vi forudsætter en høj sikkerhed for begge egenskaber

Men